如何聚合 conda 环境？

Question

我正在尝试提供一个已设置的项目及其依赖库。

两者都使用 miniconda 来定义库。

这是一个初始脚本：

#!/bin/bash

project_home_path=`dirname $( cd "$(dirname "[=10=]")" ; pwd -P )`
source /home/${USER}/miniconda/etc/profile.d/conda.sh
conda env create -f ${project_home_path}/environment.yml > /dev/null 2>&1
conda activate <env-name>
/home/${USER}/miniconda/bin/app.py & echo $! > /tmp/env-name.pid

这没有用，因为 conda activate <env-name> 行未能激活和提供所需的库。

在阅读了文档 [1] 之后，这个脚本被充实了。

#!/bin/bash

project_home_path=/home/${USER}/folder
source /home/${USER}/miniconda/etc/profile.d/conda.sh
conda env create --force -f ${project_home_path}/project/environment.yml  > /dev/null 2>&1
conda env create --force -f ${project_home_path}/library/environment.yml > /dev/null 2>&1
conda env export -n <project-env> > /tmp/env.yml
conda env update -n base -f /tmp/env.yml > /dev/null 2>&1
conda env export -n <library-env> > /tmp/env.yml
conda env update -n base -f /tmp/env.yml > /dev/null 2>&1
cd /home/${USER}/folder/library && python setup.py install
cd /home/${USER}/folder/project && python setup.py install

这确实执行了生产和工作所需的聚合，但我想知道如何才能做得更好。

[1] https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/tasks/manage-environments.html

Answer 1

创建一个环境，其中包含您需要的所有库和包。
conda env export -n MyOneEnvironment -f everything.yml

然后进行配置：

conda env create -n TheNewEnvironment -f everything.yml
conda activate TheNewEnvironment
安装任何你需要的不是 conda 包的东西

设置后，每次要在该环境中运行程序时都需要重复 conda activate 命令。

在您的第二个脚本示例中，您从 yml 文件创建两个环境，只是 re-export 已安装包的列表，然后将它们安装到基础环境中。所以你一共搞砸了三个环境。

如果要求您必须将东西安装到 conda 基础环境中，那么请收集一个 everything.yml 包含所有需要的文件，然后使用 .
但是，这样污染基地环境可不是什么好主意。如果您需要为项目或程序安装先决条件，那么您应该为此创建一个专用的 conda 环境，而不要管基础环境。然后您可以将任意数量的项目和程序安装到单独的环境中，而不会相互干扰。

如何聚合 conda 环境？

How to aggregate conda environments?

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