knitr：在报告中包含数字*和*输出数字以分隔文件

Question

我不仅希望我的数字出现在我的 knitr 生成的报告中，而且我还希望将它们输出到单独的文件中。为此，我包含了如下代码：

```{r}
  #Plot figure in report
  plot(x,y)

  #Plot figure in file
  pdf(file="MyFig.pdf")
  plot(x,y)
  dev.off()
```

这很好用，但我希望 knitr 中已经内置了一个更优雅的解决方案。是否有块选项或类似的东西可以达到相同的结果？

Answer 1

关键字 dev='pdf' 正如易辉在这里解释的 http://yihui.name/knitr/options/

连同我认为有用的其他选项：

```{r 'setup', echo = FALSE, cache = FALSE}
    opts_chunk$set(dev = c('pdf', 'png'), 
        fig.align = 'center', fig.height = 5, fig.width = 8.5, 
        pdf.options(encoding = "ISOLatin9.enc")) 
```

Answer 2

如果您使用 html_document, or keep_tex: yes if you use pdf_document，请使用选项 self_contained: no，这样 rmarkdown 将不会在渲染输出文档后删除图形文件。