如何有效地绘制大量点两两连接的线形?
How to efficiently plot a large number of line shapes where the points are connected two by two?
我需要用 plotly
绘制大量线段。与所有点都可以连接的常规散点图相反,这里我只需要两两连接点。
我考虑了不同的选择:
- 向绘图添加线条形状;显然比较慢
- 创建大量只有两个点的线图
有没有更合适的方法?可能是一个散点图,其中只有每隔几个点相连。
我正在寻找一种在 Python 中生成情节的有效方法,同时也希望获得良好的渲染性能。
此答案基于 Maximilian Peters 的评论中的建议,以及 Jezrael 对 的方法。
关键部分也是要包含fig.update_traces(connectgaps=False)
剧情:
完整代码:
import numpy as np
import pandas as pd
import plotly.express as px
import plotly.graph_objects as go
# dataframe, sample
np.random.seed(123)
cols = ['a','b','c', 'd', 'e', 'f', 'g']
X = np.random.randn(50,len(cols))
df=pd.DataFrame(X, columns=cols)
df=df.cumsum()
df['id']=df.index
# dataframe with every nth row containing np.nan
df2 = (df.iloc[1::2]
.assign(id = lambda x: x['id'] + 1, c = np.nan)
.rename(lambda x: x + .5))
df1 = pd.concat([df, df2], sort=False).sort_index().reset_index(drop=True)
df1.loc[df1.isnull().any(axis=1), :] = np.nan
df1
# plotly figure
colors = px.colors.qualitative.Plotly
fig = go.Figure()
for i, col in enumerate(df1.columns[:-1]):
fig.add_traces(go.Scatter(x=df1.index, y=df1[col],
mode='lines+markers', line=dict(color=colors[i])))
fig.update_traces(connectgaps=False)
fig.show()
我需要用 plotly
绘制大量线段。与所有点都可以连接的常规散点图相反,这里我只需要两两连接点。
我考虑了不同的选择:
- 向绘图添加线条形状;显然比较慢
- 创建大量只有两个点的线图
有没有更合适的方法?可能是一个散点图,其中只有每隔几个点相连。
我正在寻找一种在 Python 中生成情节的有效方法,同时也希望获得良好的渲染性能。
此答案基于 Maximilian Peters 的评论中的建议,以及 Jezrael 对
关键部分也是要包含fig.update_traces(connectgaps=False)
剧情:
完整代码:
import numpy as np
import pandas as pd
import plotly.express as px
import plotly.graph_objects as go
# dataframe, sample
np.random.seed(123)
cols = ['a','b','c', 'd', 'e', 'f', 'g']
X = np.random.randn(50,len(cols))
df=pd.DataFrame(X, columns=cols)
df=df.cumsum()
df['id']=df.index
# dataframe with every nth row containing np.nan
df2 = (df.iloc[1::2]
.assign(id = lambda x: x['id'] + 1, c = np.nan)
.rename(lambda x: x + .5))
df1 = pd.concat([df, df2], sort=False).sort_index().reset_index(drop=True)
df1.loc[df1.isnull().any(axis=1), :] = np.nan
df1
# plotly figure
colors = px.colors.qualitative.Plotly
fig = go.Figure()
for i, col in enumerate(df1.columns[:-1]):
fig.add_traces(go.Scatter(x=df1.index, y=df1[col],
mode='lines+markers', line=dict(color=colors[i])))
fig.update_traces(connectgaps=False)
fig.show()