如何使用 bash 脚本在 conda 环境中 运行 原子和氢？
How can I run atom and hydrogen within a conda env using bash script?
我曾经有一个简单的 bash 脚本，我用它来激活 conda env 然后 运行 atom。然后，我可以使用 hydrogen 运行 python 代码，它可以自动看到 myenv 中的包。
之前的bash scrip是这样的：
#!/bin/bash
source activate myenv &&
atom
由于 conda > 4.4 那个 'source activate' 不存在了，我只好将脚本修改为：
#!/bin/bash
source /home/ubuntu/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh &&
conda activate myenv &&
atom
但是，hydrogen 不再检测 myenv 并且 运行s 来自基本环境的代码由于基本环境中缺少包而导致错误。
当我用 spyder 替换 atom 时，上面的脚本工作正常并且 spyder 内核确实看到 myenv。
知道如何解决这个问题吗？
更新 1：
我做了更多调试。看来我的ipykernel并没有分配给激活环境中安装的内核，而是分配给了默认的ipykernel。
当我在激活环境中尝试 jupyter kernelspec list 时，我得到：
python3 /home/ubuntu/.local/share/jupyter/kernels/python3
但是在另一个系统上，我得到
/home/ubuntu/miniconda3/envs/myenv/share/jupyter/kernels/python3
这似乎是正确的内核。
知道如何解决这个问题吗？
更新二：
似乎 解决了更新 1 中的问题。然后，我能够使用接受的答案在所需的环境中加载原子，并从 ipykernel 中获得氢 运行环境
source activate 仍然像以前一样工作，尽管它不再是激活环境的首选方式。
如果你只是运行一个命令，试试
conda run -n <envname> <command>
可能首先获取配置文件。
我没试过，但一个潜在的问题是您在获取配置文件后使用 &&。我假设当你写这个问题时，行继续字符 (\) 在那里丢失了。只需将命令写入单独的行，以便在 在 bash 处理下一个命令之前加载配置文件。
我曾经有一个简单的 bash 脚本，我用它来激活 conda env 然后 运行 atom。然后，我可以使用 hydrogen 运行 python 代码，它可以自动看到 myenv 中的包。
之前的bash scrip是这样的：
#!/bin/bash
source activate myenv &&
atom
由于 conda > 4.4 那个 'source activate' 不存在了，我只好将脚本修改为：
#!/bin/bash
source /home/ubuntu/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh &&
conda activate myenv &&
atom
但是，hydrogen 不再检测 myenv 并且 运行s 来自基本环境的代码由于基本环境中缺少包而导致错误。
当我用 spyder 替换 atom 时，上面的脚本工作正常并且 spyder 内核确实看到 myenv。
知道如何解决这个问题吗？
更新 1：
我做了更多调试。看来我的ipykernel并没有分配给激活环境中安装的内核，而是分配给了默认的ipykernel。
当我在激活环境中尝试 jupyter kernelspec list 时，我得到：
python3 /home/ubuntu/.local/share/jupyter/kernels/python3
但是在另一个系统上，我得到
/home/ubuntu/miniconda3/envs/myenv/share/jupyter/kernels/python3
这似乎是正确的内核。
知道如何解决这个问题吗？
更新二：
似乎
source activate 仍然像以前一样工作，尽管它不再是激活环境的首选方式。
如果你只是运行一个命令，试试
conda run -n <envname> <command>
可能首先获取配置文件。
我没试过，但一个潜在的问题是您在获取配置文件后使用 &&。我假设当你写这个问题时，行继续字符 (\) 在那里丢失了。只需将命令写入单独的行，以便在 在 bash 处理下一个命令之前加载配置文件。