从视频中创建 Dicom 文件

Question

我是 DICOM 和 fo-dicom 图书馆的新手。我正在尝试从 OCT 眼睛扫描视频中创建一个 DICOM 文件。首先，我提取视频的帧，然后使用 fo-dicom.

创建一个 DICOM 文件

public static void CreateDicomFromVideo(string path)
{
    List<Bitmap> videoFrames = GetVideoFrames(path);
    CreateDicomFromFrames(videoFrames);
}

private static List<Bitmap> GetVideoFrames(string path)
{
    List<Bitmap> videoFrames = new List<Bitmap>();
    using (var vFReader = new VideoFileReader())
    {
        vFReader.Open(path);
        for (int i = 0; i < vFReader.FrameCount; i++)
        {
            Bitmap bmpBaseOriginal = vFReader.ReadVideoFrame();
            videoFrames.Add(bmpBaseOriginal);
        }
        vFReader.Close();
    }
    if (videoFrames.Count > 0)
        return videoFrames;
    else return null;
}

private static void CreateDicomFromFrames(List<Bitmap> videoFrames)
{
    DicomDataset dataset = new DicomDataset();
    FillDataset(dataset);

    int i = 0;
    foreach (Bitmap item in videoFrames)
    {
        Bitmap bitmap = new Bitmap(item);
        bitmap = GetValidImage(bitmap);
        int rows, columns;
        byte[] pixels = GetPixels(bitmap, out rows, out columns);
        MemoryByteBuffer buffer = new MemoryByteBuffer(pixels);
        if (i == 0)
        {
            dataset.Add(DicomTag.PhotometricInterpretation, PhotometricInterpretation.Rgb.Value);
            dataset.Add(DicomTag.Rows, (ushort)rows);
            dataset.Add(DicomTag.Columns, (ushort)columns);
            dataset.AddOrUpdate(DicomTag.BitsAllocated, (ushort)8);

        }

        DicomPixelData pixelData = DicomPixelData.Create(dataset, true);
        pixelData.BitsStored = 8;
        //pixelData.BitsAllocated = 8;
        pixelData.SamplesPerPixel = 3;
        pixelData.HighBit = 7;
        pixelData.PixelRepresentation = 0;
        pixelData.PlanarConfiguration = 0;
        pixelData.AddFrame(buffer);
        i++;
    }

    DicomFile dicomfile = new DicomFile(dataset);            
    dicomfile.Save(@"D:\DICOM\files\Video files\dicomfile.dcm");
}

我希望收到包含视频中所有帧的 DICOM 文件，但收到的 DICOM 文件只有一帧。

Answer 1

我不是 fo-DICOM 专家，但您的代码显然没有语法问题。

DicomPixelData pixelData = DicomPixelData.Create(dataset, true);

您每次都在循环中创建像素数据的新实例。将它移到上面的循环之外。 pixelData.AddFrame.

每次（在循环中）使用相同的 DicomPixelData 实例

其他几个元素也是如此。 PhotometricInterpretation、Rows、Columns、BitsAllocated等只需要分配一次。将这些赋值移到上面的循环之外。

基本上，您的循环应该只继续向现有像素数据实例添加新帧。

从视频中创建 Dicom 文件

Creating Dicom file out of video

c#

dicom

fo-dicom