仅在 Slurm 中提交 python 作业时出错

Question

我是运行远程机器上的 python 脚本，它运行良好，但启动后不久我收到警告：

QStandardPaths: XDG_RUNTIME_DIR not set, defaulting to '/tmp/runtime-myusername'

我不担心这个警告，因为它不会停止我的代码。

然后我尝试使用 Slurm 工作负载管理器提交相同的代码，使用命令：

sbatch --wrap="python mycode.py" -N 1 --cpus-per-task=8 -o mycode.o

当我这样做时，代码不起作用，并且出现以下错误：

Traceback (most recent call last):
  File "mycode.py", line 99, in <module>
    fig=plt.figure(figsize=(20, 12), dpi = 100, facecolor='w', edgecolor='k')
  File "/home/myusername/miniconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/pyplot.py", line 539, in figure
**kwargs)
  File "/home/myusername/miniconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/backend_bases.py", line 3252, in new_figure_manager
return cls.new_figure_manager_given_figure(num, fig)
  File "/home/myusername/miniconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/backends/_backend_tk.py", line 946, in new_figure_manager_given_figure
window = tk.Tk(className="matplotlib")
  File "/home/myusername/miniconda3/lib/python3.7/tkinter/__init__.py", line 2023, in __init__
self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)_tkinter.TclError: couldn't connect to display "localhost:36.0"

很明显这个错误与我正在制作的图形有关。我不确定它是否与 XDG_RUNTIME_DIR 警告有关。

如有任何帮助，我们将不胜感激。

Answer 1

我认为您的问题与以下线程有关

tkinter.TclError: couldn't connect to display "localhost:18.0"

如下更改导入的解决方案

import matplotlib
matplotlib.use('pdf')
import matplotlib.pyplot as plt

几个线程

仅在 Slurm 中提交 python 作业时出错

Error only when submitting python job in Slurm

python

slurm