加载共享库时出错：libicuuc.so.50

Question

我尝试在 CentOS 7 中向 SLURM 提交 R 脚本，如下所示：

#!/bin/bash
#SBATCH -J test                   
#SBATCH -o test.out               
#SBATCH -p compute                
#SBATCH --qos=normal              
#SBATCH -N 1                      
#SBATCH --ntasks-per-node=8       
#SBATCH --cpus-per-task=1         
#SBATCH --job-name=rtest

Rscript --vanilla Rhelp.R

然后系统会return一个jobid，但是R脚本不起作用。我可以保证这个脚本可以在命令行中运行。然后我在test.out里找到了，像这样：

error while loading shared libraries: libicuuc.so.50: 
cannot open shared object file: No such file or directory

我是 SLURM 的新生，Linux，谢谢！

Answer 1

看起来 libicu RPM 包没有安装在计算节点上。

Answer 2

仅仅因为它可能安装在头节点上并不意味着它安装在计算节点上。您可以在 Slurm 作业中启动相同的 ldconfig 命令并查看结果以确认情况是否如此。

Answer 3

使用来自头节点的 module avail 命令，您可以列出所有可用模块，并且 loaded 模块会根据您的 OS 以某种方式进行标记；对我来说，它们标有 (L)。您需要做的就是从您的文件脚本中加载那些已加载的模块，每个模块都使用以下行调用 module load path_to_module。然而，path_to_module 与前面的命令 module avail 所指示的一样。或者不求助于 module avail，您可以对当前加载的模块使用 module list。

加载共享库时出错：libicuuc.so.50

error while loading shared libraries: libicuuc.so.50

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