cupy map_coordinates 给出形状不匹配的错误
cupy map_coordinates gives out shape is mismatched error
我正在尝试使用 cupy
的 scipy
兼容功能,即 map_coordinates
功能。但是,经过大量修补后,我无法让它工作。所以,我做了如下事情:
import cupy as cp
import cupyx
import cupyx.scipy.ndimage
import numpy as np
# Generate some random data
x = np.random.rand(10, 10, 10)
# Move it to the GPU
x = cp.array(x)
# Generate some coordinates
d = [cp.array(np.random.rand(10, 10, 10)),
cp.array(np.random.rand(10, 10, 10)),
cp.array(np.random.rand(10, 10, 10))]
d = cp.stack(d)
print(d.shape) # (3, 10, 10, 10)
cupyx.scipy.ndimage.map_coordinates(x, d, cp.float32, order=1,
mode='constant', cval=0)
现在,这个 returns 错误:ValueError: Out shape is mismatched
。
我现在不确定为什么会这样,因为输出应该由函数本身生成。想想看,坐标是正确的 4D 形状。我真的不知道如何进行这项工作。不幸的是,我在网上也找不到任何这样的工作示例。
这看起来像是 CuPy(v6 和 v7 beta2)的一个错误。我提交了 issue。它仅在输出具有多个轴时失败,因此在错误修复之前,您可以通过展平除第一个轴以外的坐标数组来解决此错误,例如:
cupyx.scipy.ndimage.map_coordinates(
x, d.reshape(len(d), -1), order=1, mode='constant', cval=0
).reshape(d.shape[1:])
我正在尝试使用 cupy
的 scipy
兼容功能,即 map_coordinates
功能。但是,经过大量修补后,我无法让它工作。所以,我做了如下事情:
import cupy as cp
import cupyx
import cupyx.scipy.ndimage
import numpy as np
# Generate some random data
x = np.random.rand(10, 10, 10)
# Move it to the GPU
x = cp.array(x)
# Generate some coordinates
d = [cp.array(np.random.rand(10, 10, 10)),
cp.array(np.random.rand(10, 10, 10)),
cp.array(np.random.rand(10, 10, 10))]
d = cp.stack(d)
print(d.shape) # (3, 10, 10, 10)
cupyx.scipy.ndimage.map_coordinates(x, d, cp.float32, order=1,
mode='constant', cval=0)
现在,这个 returns 错误:ValueError: Out shape is mismatched
。
我现在不确定为什么会这样,因为输出应该由函数本身生成。想想看,坐标是正确的 4D 形状。我真的不知道如何进行这项工作。不幸的是,我在网上也找不到任何这样的工作示例。
这看起来像是 CuPy(v6 和 v7 beta2)的一个错误。我提交了 issue。它仅在输出具有多个轴时失败,因此在错误修复之前,您可以通过展平除第一个轴以外的坐标数组来解决此错误,例如:
cupyx.scipy.ndimage.map_coordinates(
x, d.reshape(len(d), -1), order=1, mode='constant', cval=0
).reshape(d.shape[1:])