在 R 脚本中调用函数

Question

我编写了一个 R 脚本，其中我编写了一个函数并调用了该函数。这是整个脚本：

PrepData = function(infile){
        data <- read.table(infile, header=TRUE, as.is = TRUE, sep = ",")
        data = data[, 2:ncol(data)]
                 merged.data = data
        colnames(merged.data[1]) < "CodeCount"
        rownames(merged.data) <- merged.data$Name
        x <- list(counts = merged.data, raw.counts = merged.data)
 return(x)
}



data <- PrepData(myfile.csv)
data

但是当我运行它使用以下命令时：

Rscript myscript.r

它给出了这个错误：

Error in read.table(infile, header = TRUE, as.is = TRUE, sep = ",") : 
  object 'myfile.csv' not found
Calls: PrepData -> read.table
Execution halted

你知道怎么解决吗？

Answer 1

尝试改变

data <- PrepData(myfile.csv)

到

data <- PrepData("myfile.csv")

使用读取table功能时，文件名需要有引号。

在 R 脚本中调用函数

calling a function in R script

function

rscript