R:更改空间点叠加的栅格值

R: change raster values where spatial points overlay

考虑以下数据:

library(sp)  
library(raster)

# create raster
r <- matrix(c(1.8, 1.2, 1.8, 1.2, 2.5, 2.7, 8.5, 7, 2), 3,3)

r <- raster(r)
extent(r) <- c(45,46,54,55)
projection(r) <- "+proj=utm +zone=33 +ellps=GRS80 +units=m +no_defs"

# create points
coords <- data.frame(x = c(45.6, 45.2),
                     y = c(54.8, 54.2))

data <- data.frame(a = c(20,22), b = c(1.5, 2.5))
p <- SpatialPointsDataFrame(coords = coords,
                           data = data, 
                           proj4string = crs(r))

plot(r)
plot(p, add=TRUE)

我有 2 个点覆盖 2 个栅格单元。我想用 SpatialPointsDataFrame pa 的值替换这些栅格像元值。因此,我将 SpatialPointsDataFrame 转换为栅格:

p_ras <- rasterize(x = p, y = r, field = "a")

如何使用 p_ras 的值更新 r 的值,其中 p_ras 具有非空单元格值并按位置将值分配给 r

我自己通过研究这个 post 的答案找到了答案:https://gis.stackexchange.com/questions/95481/in-r-set-na-cells-in-one-raster-where-another-raster-has-values

我的解决方案是使用 raster 包中的 overlay

r_mod <- overlay(r, p_ras, fun = function(x, y){

  x[!is.na(y[])] <- y[!is.na(y[])]
  return(x)

})

这是一个使用 cellXY

的解决方案
############# START ORIGINAL CODE ############# 
library(sp)  
library(raster)
#> Warning: package 'raster' was built under R version 3.6.1

# create raster
r <- matrix(c(1.8, 1.2, 1.8, 1.2, 2.5, 2.7, 8.5, 7, 2), 3,3)

r <- raster(r)
extent(r) <- c(45,46,54,55)
projection(r) <- "+proj=utm +zone=33 +ellps=GRS80 +units=m +no_defs"

# create points
coords <- data.frame(x = c(45.6, 45.2),
                     y = c(54.8, 54.2))

data <- data.frame(a = c(1,2), b = c(1.5, 2.5))
p <- SpatialPointsDataFrame(coords = coords,
                            data = data, 
                            proj4string = crs(r))

############# END ORIGINAL CODE ############# 

我所做的是查找与 cellXY 坐标对应的单元格,然后将值替换为 p$a 值。

# Save original raster for comparison
r_before <- r

# Update cells
r[cellFromXY(r, p@coords)] <- p$a

# Plot difference
plot(r - r_before)
plot(p, add=TRUE)

reprex package (v0.3.0)

于 2019-08-15 创建

该图显示了原始栅格和新更新栅格之间的差异。仅更新了相关单元格。

您的示例数据

library(raster)
r <- raster(ncol=3, nrow=3, ext=extent(c(45,46,54,55)), crs = "+proj=utm +zone=33 +ellps=GRS80 +units=m")
values(r) <- c(1.8, 1.2, 1.8, 1.2, 2.5, 2.7, 8.5, 7, 2)
coords <- data.frame(x = c(45.6, 45.2), y = c(54.8, 54.2))
data <- data.frame(a = c(20,22), b = c(1.5, 2.5))
p <- SpatialPointsDataFrame(coords = coords, data = data, proj4string = crs(r))

rasterize 的方向是正确的。只需添加参数 update=TRUE

x <- rasterize(p, r, field="a", update=TRUE)

相当于

p_ras <- rasterize(p, r, field = "a")
p_ras <- cover(p_ras, r)

这应该比 overlay 更清晰、更有效。 xyFromCell 的方法对于大对象是有风险的,因为它可能会强制所有值进入内存。