如何用白色填充闭合轮廓区域

Question

我正在尝试仅使用 ROI 在细胞图像中做一个蒙版，因此我在 ROI 周围使用 OpenCV 应用了轮廓，但我一直在努力使区域位于轮廓内。我想让这个区域在白色内部，然后丢弃轮廓和其余部分。

cell = cv.imread(original, 0) # original cell image after matching template
imgray = cv.cvtColor(cell,cv.COLOR_BGR2GRAY) 
ret,thresh_binary = cv.threshold(imgray,127,255,cv.THRESH_BINARY)

生成的图像是：

而原文是：

从另一张图片匹配模板和已经标记好的细胞轮廓后，代码中读取的图片：

所以基本上我需要的是在那个封闭的轮廓区域有白色并丢弃所有其余部分（即黑色）。有人可以给我一些帮助或提示我该怎么做吗？

Answer 1

这是一个方法：

将图像转换为灰度
找到等高线并填充等高线
执行形态转换以删除不需要的部分

我们找到轮廓然后用cv2.drawContours()填充轮廓，使用-1作为厚度参数

要删除行部分，我们可以使用morphological transformations

import cv2

image = cv2.imread('1.png')
gray = cv2.cvtColor(image, cv2.COLOR_BGR2GRAY)

cnts = cv2.findContours(gray, cv2.RETR_EXTERNAL, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
cnts = cnts[0] if len(cnts) == 2 else cnts[1]

for c in cnts:
    cv2.drawContours(gray,[c], 0, (255,255,255), -1)

kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT, (20,20))
opening = cv2.morphologyEx(gray, cv2.MORPH_OPEN, kernel, iterations=2)

cv2.imshow('gray', gray)
cv2.imshow('opening', opening)
cv2.imwrite('opening.png', opening)
cv2.waitKey(0)

如何用白色填充闭合轮廓区域

How to fill closed contour region with white

python

opencv

image-processing

image-segmentation

scikit-image