matlab 中的 glmnet Mex 文件无效

Question

我在 macOS 10.14.5 的 MATLAB 2019a 上运行 glmnet 包。我还在笔记本电脑上安装了 Xcode。

我收到如下错误：

Invalid MEX-file '/Users/Desktop/Research/Paper Code/glmnet/glmnetMex.mexmaci64' : dlopen(/Users/Desktop/Research/Paper Code/glmnet/glmnetMex.mexmaci64,
6): Library not loaded: @loader_path/libmex.dylib
  Referenced from: /Users/Desktop/Research/Paper Code/glmnet/glmnetMex.mexmaci64

我试过密码 mex -setup 得到了

MEX configured to use 'Xcode with Clang' for C language compilation.
Warning: The MATLAB C and Fortran API has changed to support MATLAB variables with more than 2^32-1 elements. 
In the near future you will be required to update your code to utilize the new API. 
You can find more information about this at:  http://www.mathworks.com/help/matlab/matlab_external/upgrading-mex-files-to-use-64-bit-api.html.

我从 mathworks 那里找到了一些针对 mex 的建议，但我不确定这是否可以解决我的问题。我在这里停了下来，因为我不确定我是否应该按照这个答案删除一些东西。

有什么想法吗？

Answer 1

Glmnet 下载中包含的 glmnetMex MEX 文件在较新版本的 macOS 上看起来很糟糕，因为它是在更旧版本的 macOS (OS X 10.8, according to their website) 上编译的，并且 DLL 库加载机制从那以后发生了变化。（它应该使用 @rpath 而不是 @loader_path。）您需要自己重建 MEX 文件，或者联系 Glmnet 维护者并要求他们提供新的构建。

重建 MEX 文件：

使用 mex -setup 设置 Matlab 以使用可以编译 Fortran MEX 文件的编译器。（我实际上不知道该怎么做。）
在Matlab中，cd到glmnet_matlab目录，!rm glmnetMex.mexmaci64，然后运行 mex glmnetMex.F

我认为这是 Glmnet 发行版中的一个错误；我已将其报告给上游的 Glmnet 维护者。

（我也可以通过在我的 macOS 10.14.6 机器运行上使用 Matlab R2019a 重新下载 Glmnet 来重现这个问题。）

这是另一个 Matlab 库的预构建 MEX 文件的类似问题：。下次尝试使用谷歌搜索错误消息的各个部分；搜索 "Library not loaded: @loader_path/libmex.dylib" 将提出该问题。

Answer 2

@Andrew Janke 的回答很有效，除了第二步我需要使用

进行编译

mex FFLAGS='-fdefault-real-8 -ffixed-form -compatibleArrayDims' glmnetMex.F GLMnet.f

另见此处：https://github.com/growlix/glmnet_matlab

我是运行 MATLAB 2019a 和 MacOS 10.15.3。

matlab 中的 glmnet Mex 文件无效

Invalid glmnet Mex file in matlab

macos

matlab

mex

glmnet