绘制 K 折交叉验证的 ROC 曲线

Question

我正在处理一个不平衡的数据集。在应用 ML 模型之前将数据集拆分为测试和训练集后，我应用 SMOTE 算法来平衡数据集。我想应用交叉验证并绘制每个折叠的 ROC 曲线，显示每个折叠的 AUC，并在图中显示 AUC 的平均值。我将重新采样的训练集变量命名为 X_train_res 和 y_train_res，以下是代码：

cv = StratifiedKFold(n_splits=10)
classifier = SVC(kernel='sigmoid',probability=True,random_state=0)

tprs = []
aucs = []
mean_fpr = np.linspace(0, 1, 100)
plt.figure(figsize=(10,10))
i = 0
for train, test in cv.split(X_train_res, y_train_res):
    probas_ = classifier.fit(X_train_res[train], y_train_res[train]).predict_proba(X_train_res[test])
    # Compute ROC curve and area the curve
    fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y_train_res[test], probas_[:, 1])
    tprs.append(interp(mean_fpr, fpr, tpr))
    tprs[-1][0] = 0.0
    roc_auc = auc(fpr, tpr)
    aucs.append(roc_auc)
    plt.plot(fpr, tpr, lw=1, alpha=0.3,
             label='ROC fold %d (AUC = %0.2f)' % (i, roc_auc))

    i += 1
plt.plot([0, 1], [0, 1], linestyle='--', lw=2, color='r',
         label='Chance', alpha=.8)

mean_tpr = np.mean(tprs, axis=0)
mean_tpr[-1] = 1.0
mean_auc = auc(mean_fpr, mean_tpr)
std_auc = np.std(aucs)
plt.plot(mean_fpr, mean_tpr, color='b',
         label=r'Mean ROC (AUC = %0.2f $\pm$ %0.2f)' % (mean_auc, std_auc),
         lw=2, alpha=.8)

std_tpr = np.std(tprs, axis=0)
tprs_upper = np.minimum(mean_tpr + std_tpr, 1)
tprs_lower = np.maximum(mean_tpr - std_tpr, 0)
plt.fill_between(mean_fpr, tprs_lower, tprs_upper, color='grey', alpha=.2,
                 label=r'$\pm$ 1 std. dev.')

plt.xlim([-0.01, 1.01])
plt.ylim([-0.01, 1.01])
plt.xlabel('False Positive Rate',fontsize=18)
plt.ylabel('True Positive Rate',fontsize=18)
plt.title('Cross-Validation ROC of SVM',fontsize=18)
plt.legend(loc="lower right", prop={'size': 15})
plt.show()

以下是输出：

请告诉我绘制交叉验证的 ROC 曲线的代码是否正确。

Answer 1

The problem is that I do not clearly understand cross-validation. In the for loop range, I have passed the training sets of X and y variables. Does cross-validation work like this?

撇开 SMOTE 和不平衡问题不谈，它们没有包含在您的代码中，您的程序看起来是正确的。

更详细地说，对于你的每一个 n_splits=10:

你创建 train 和 test 折叠

您使用 train 折叠拟合模型：

  classifier.fit(X_train_res[train], y_train_res[train])

然后使用 test 折叠预测概率：
```
   predict_proba(X_train_res[test])
```

这正是交叉验证背后的想法。

因此，由于您有 n_splits=10，您得到 10 条 ROC 曲线和各自的 AUC 值（及其平均值），与预期完全一致。

然而:

由于 class 不平衡而需要 (SMOTE) 上采样改变了正确的程序，并使您的整个过程 不正确 ：您应该 not 对您的初始数据集进行上采样；相反，您需要将上采样过程合并到 CV 过程中。

因此，此处针对您的每个 n_splits 的正确程序变为（请注意，正如您所做的那样，从分层 CV 拆分开始，在 class 不平衡情况下变得至关重要）：

创建 train 和 test 折叠
使用 SMOTE

train

使用上采样 train 倍
使用 test 折叠（未上采样）预测概率

有关基本原理的详细信息，请参阅数据科学 SE 线程中自己的回答 Why you shouldn't upsample before cross validation。

绘制 K 折交叉验证的 ROC 曲线

Plotting the ROC curve of K-fold Cross Validation

python

machine-learning

roc

scikit-learn

cross-validation