在 Google App Engine Flex 和 Docker 中使用 plumber 部署 R 时出错

Question

在做什么？

我正在尝试使用 docker 容器在 Google App Engine Flex 上部署 R 模型。我最终的 objective 是将模型作为 API。使用水管工和 docker 容器部署应用程序时出现错误。

R 代码与管道工运行在我使用 RStudio 的本地计算机上很好。但是现在我正在使用带有 R 的 AI 平台 jupyter 笔记本。我使用 Docker 运行 image-name 命令在本地测试了 docker 并且我收到了一次以下消息 Docker 运行.

Starting server to listen on port 8080

当我在本地 Rstudio 中运行 R + plumber 代码时，我收到以下消息

Starting server to listen on port 8080
Running the swagger UI at http://127.0.0.1:8080/__swagger__/

在此之后我运行 gcloud app deploy（这再次构建 docker 图像等），构建运行s 超过 15分钟并失败并显示错误消息，如最后所示。

代码等详情：

app.yaml

service: iris-custom
runtime: custom
env: flex

manual_scaling:
  instances: 1

resources:
  cpu: 1
  memory_gb: 0.5
  disk_size_gb: 20

# added below to increase app_start_timeout_sec  
readiness_check:
  path: "/readiness_check"
  check_interval_sec: 5
  timeout_sec: 4
  failure_threshold: 2
  success_threshold: 2
  app_start_timeout_sec: 900

Docker文件

FROM gcr.io/gcer-public/plumber-appengine

# install the linux libraries needed for plumber
RUN export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive; apt-get -y update \
&& apt-get install -y

# install plumber commented as plumber is preinstalled
#RUN R -e "install.packages(c('plumber'), repos='http://cran.rstudio.com/')"

# copy everything from the current directory into the container
WORKDIR /payload/
COPY [".", "./"]

# open port 8080 to traffic
EXPOSE 8080

# when the container starts, start the main.R script
ENTRYPOINT ["Rscript", "main.R"]

main.R

library(plumber)
r <- plumb("rest_controller.R")
r$run(port=8080, host="0.0.0.0")

rest_controller.R

#* @get /predict_petal_length
get_predict_length <- function(){

  dataset <- iris

  # create the model
  model <- lm(Petal.Length ~ Petal.Width, data = dataset)
  petal_width = "0.4"

  # convert the input to a number
  petal_width <- as.numeric(petal_width)

  #create the prediction data frame
  prediction_data <- data.frame(Petal.Width=petal_width)

  # create the prediction
  predict(model,prediction_data)
}

错误信息：

ERROR: (gcloud.app.deploy) Error Response: [4] Your deployment has failed to become healthy in the allotted time and therefore was rolled back. If you believe this was an error, try adjusting the 'app_start_timeout_sec' setting in the 'readiness_check' section.

我尝试了一点修改代码，部署成功但应用引擎仍然无法运行。 issue with code link

Answer 1

从 Google Cloud Doku 看来，为了让您的应用程序通过，它需要 return http 状态代码 200（参见 https://cloud.google.com/appengine/docs/flexible/custom-runtimes/configuring-your-app-with-app-yaml#updated_health_checks）。

但是您的应用程序 return 在您为 redincess 检查定义的路径上的 http 状态代码 404，因为它不存在。

readiness_check:
 path: "/readiness_check"

所以我建议将此路径作为一个选项添加到您的 rest_controller.R 文件中，例如

#* @get /readiness_check
readiness_check<- function(){
    return ("app ready")
}

或修改您的 app.yml 以便它检查 get_predict_length enpoint

readiness_check:
  path: "/get_predict_length"

在 Google App Engine Flex 和 Docker 中使用 plumber 部署 R 时出错

Error while deploying R using plumber in Google App Engine Flex with Docker

r

docker

google-app-engine

plumber