Tidyverse 命令已被弃用：T test inside a summarize ，然后报告所有结果

Question

我几乎每天都使用 tidyverse（及其环境），而且有时我不得不回来进行 previous/old 分析。不幸的是，跟踪对包所做的更改并不容易。

这个脚本非常实用，它执行我想要的（它在一个函数中与其他命令一起使用）

ds <- data.frame(result = rnorm(100,5,2),
                 time = c("1","2"))
library(tidyverse)
library(broom)

ds %>% 
  summarise_at(vars("result"),
               funs(list(tidy(t.test(. ~ time, paired=TRUE))))) %>% map(1)

我知道这不是最优雅的语法。现在，此消息出现在命令之后：

funs() 从 dplyr 0.8.0 开始被软弃用请使用函数或 lambda 的列表：

  # Simple named list: 
  list(mean = mean, median = median)

  # Auto named with `tibble::lst()`: 
  tibble::lst(mean, median)

  # Using lambdas
  list(~ mean(., trim = .2), ~ median(., na.rm = TRUE))

我所有的修复尝试都给了我一条消息...

> ds %>% 
+   summarise_at(vars("result"),
+                lst(tidy(t.test(. ~ time, paired=TRUE)))) %>% map(1)
Error in model.frame.default(formula = . ~ time) : 
  invalid type (list) for variable '.'
> ds %>% 
+   summarise_at(vars("result"),
+                list(list(tidy(t.test(. ~ time, paired=TRUE))))) %>% map(1)
Error in model.frame.default(formula = . ~ time) : 
  invalid type (list) for variable '.'
> ds %>% 
+   summarise_at(vars("result"),
+                list(list(tidy(~ t.test(. ~ time, paired=TRUE))))) %>% map(1)
Error: No tidy method for objects of class formula

所以.. 第一个问题：关于修复它的任何线索？
second：我在哪里可以关注这些（持续）更新？
三：我使用tidyverse是因为我喜欢它处理命令的方式。它非常直观，但我认为这是一个重要的副作用，它不断变化......我是否应该尝试将我的所有例程移至 R base（可能 R base 不会改变其功能......）？

谢谢大家

Answer 1

这个怎么样？

ds <- data.frame(result = rnorm(100,5,2),
                 time = c("1","2"))

library(tidyverse)
library(broom)

ds %>% 
  summarise_at(vars("result"),
               list(~ list(tidy(t.test(. ~ time, paired=TRUE))))) %>% map(1)
#> $result
#> # A tibble: 1 x 8
#>   estimate statistic p.value parameter conf.low conf.high method
#>      <dbl>     <dbl>   <dbl>     <dbl>    <dbl>     <dbl> <chr> 
#> 1   -0.719     -1.77  0.0823        49    -1.53    0.0955 Paire~
#> # ... with 1 more variable: alternative <chr>

^{由 reprex package (v0.3.0)}

于 2019-09-04 创建

Tidyverse 命令已被弃用：T test inside a summarize ，然后报告所有结果

Tidyverse commands are becoming deprecated: T test inside a summarise , then report all results

r

dplyr

tidyverse

broom