HDFql 将数据添加到现有数据集

Question

我想用 C++ 创建一个 HDF5 文件，然后将数据动态添加到该文件中包含的数据集。然而，我在完成这项工作时遇到了一些麻烦，这个最小的例子是我目前的最佳尝试（主要基于 by SOG）：

#include <stdio.h>
#include <HDFql.hpp>

int main (int argc, const char * argv[]) {
    char script[1024];

    //Create HDF5 file
    HDFql::execute("CREATE TRUNCATE FILE /tmp/test.h5");
    HDFql::execute("USE FILE /tmp/test.h5");

    //Generate some arbitrary data
    int data_size = 10;
    int data[data_size];
    for (int i=0; i<data_size; i++) {data[i]=i+data_size;}

    //Create a dataset "dset"
    HDFql::execute("CREATE CHUNKED DATASET dset AS INT(UNLIMITED)");
    //In the loop, add one element to dset on each iteration
    for(int i=0; i<10; i++)
    {
        HDFql::execute("ALTER DIMENSION dset TO (+1)");
        sprintf(script, "INSERT INTO dset(-1:1:1:1) VALUES(%d)", i);
        HDFql::execute(script);
    }
    //Add an array of values to dset
    sprintf(script, "ALTER DIMENSION dset TO (%d)", data_size);
    HDFql::execute(script);
    sprintf(script, "INSERT INTO dset(-1:1:1:1) VALUES(%d)", data_size);
    HDFql::execute(script);

    //Read all values in dset and print to console
    HDFql::execute("SELECT FROM dset");
    int cnt=0;
    while(HDFql::cursorNext(NULL) == HDFQL_SUCCESS)
    {
        printf("Value at %d: %d\n", cnt, *HDFql::cursorGetInt(NULL));
        cnt++;
    }

    HDFql::execute("CLOSE FILE");
}

我希望控制台的输出是：

Value at 0: 0
Value at 1: 1
Value at 2: 2
...
Value at 19: 19

相反，输出是：

Value at 0: 10

事实上，检查 HDF5 文件显示它只包含一个值，10。那么我的代码有什么问题，为什么？此外，非常感谢对 hyperslab 的简短解释（我在这里盲目地使用它）或 link 解释它的文档。

非常感谢！

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这是一个基于@SOG 回答的工作代码示例：

#include <stdio.h>
#include <HDFql.hpp>

int main (int argc, const char * argv[]) {
    char script[1024];

    HDFql::execute("CREATE TRUNCATE FILE /tmp/test.h5");
    HDFql::execute("USE FILE /tmp/test.h5");

    int data_size = 10;
    int data[data_size];
    for (int i=0; i<data_size; i++) {data[i]=i+data_size;}

    HDFql::execute("CREATE CHUNKED DATASET dset AS INT(UNLIMITED)");
    for(int i=0; i<10; i++)
    {
        if(i>0) {HDFql::execute("ALTER DIMENSION dset TO +1");}
        sprintf(script, "INSERT INTO dset(-1:1:1:1) VALUES(%d)", i);
        HDFql::execute(script);
    }
    sprintf(script, "ALTER DIMENSION dset TO +%d", data_size);
    HDFql::execute(script);
    sprintf(script, "INSERT INTO dset(-%d:1:1:%d) VALUES FROM MEMORY %d",
            data_size, data_size, HDFql::variableTransientRegister(data));
    HDFql::execute(script);


    int cnt=0;
    HDFql::execute("SELECT FROM dset");
    while(HDFql::cursorNext(NULL) == HDFQL_SUCCESS)
    {
        printf("Value at %d: %d\n", cnt, *HDFql::cursorGetInt(NULL));
        cnt++;
    }

    HDFql::execute("CLOSE FILE");
}

Answer 1

根据 HDFql release notes，操作 ALTER DIMENSION 在 2.1.0 版中更改了语法（即操作不再需要括号来包围维度）。

因此，将您的代码更改为：

HDFql::execute("ALTER DIMENSION dset TO +1");

可以在 HDFql reference manual.

中找到有关此操作以及超平板的其他信息

HDFql 将数据添加到现有数据集

HDFql Adding Data to Existing Dataset

hdf5

hdf

hdfql

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