使用重命名的输出使目录不重命名文件

Question

我有一个包含多个文件的目录，它们都以“_1.fastq.gz”或“_2.fastq.gz”结尾。

ERR3258060_1.fastq.gz  
ERR3258060_2.fastq.gz  
ERR3258861_1.fastq.gz  
ERR3258861_2.fastq.gz

我想要做的（第一步）是获取所有以 _1.fastq.gz 结尾的文件，保留文件名的前 10 个字符（ERR32.....）并创建一个目录有了那个

因此目录看起来像 ERR3258060 ERR3258861

使用 bash 目前我已经尝试了以下方法

for f in *_1.fastq.gz
do
echo $f | rename -n 's/_1.fastq.gz//' * | mkdir
done

该命令以我想要的方式生成文件名，但 mkdir 不会获取重命名的输出，它只会说 "missing operand" 如何让 mkdir 获取上一个命令的结果？

谢谢

Answer 1

无需使用rename。您可以只使用 sed。在第一步中，您创建目录名称，然后在 mkdir.

中使用它

for f in *_1.fastq.gz
do
    dir=$(echo $f | sed 's/_1.fastq.gz//')
    mkdir $dir
done

use the output of rename to make directory wo renaming the files