pyimagej 设置 + conda：不存在 Java 运行时，请求安装

Question

问题

我正在尝试使用 pyimagej==0.4.0 (source)。根据其自述文件，我运行以下代码：

import imagej
ij = imagej.init()

并且 returns 出现以下错误：No Java runtime present, requesting install.

我在多篇文章中查到了这个错误：

https://apple.stackexchange.com/q/283858/327668

两篇文章都说我需要完整的 JDK，而不仅仅是 JRE。但是，我想我有完整的 JDK.

背景

pyimagej==0.4.0
macOS Mojave v10.14.3
miniconda 4.6.14

设置 conda 环境：

conda create -n pyimagej pyimagej openjdk=8
conda activate pyimagej

检查环境：

(pyimagej) ➜  fiji_test java -version
openjdk version "1.8.0_192"
OpenJDK Runtime Environment (Zulu 8.33.0.1-macosx) (build 1.8.0_192-b01)
OpenJDK 64-Bit Server VM (Zulu 8.33.0.1-macosx) (build 25.192-b01, mixed mode)
(pyimagej) ➜  fiji_test echo $JAVA_HOME
/usr/local/Caskroom/miniconda/base/envs/pyimagej

你能填写我遗漏的内容吗？预先感谢您的任何建议。

Answer 1

原来问题出在杂草上。

pyimagej 的一位开发人员似乎遇到了这个问题：https://github.com/imagej/pyimagej/issues/10

开发人员提出了一个直接修改 jdk 的 Info.plist 的短期解决方法。

开发者也开了一个PR，希望得到更长久的解决方案。希望它被关闭，然后希望没有其他人会遇到这个！ :)

pyimagej 设置 + conda：不存在 Java 运行时，请求安装

pyimagej setup + conda: No Java runtime present, requesting install

java

python

java-8

imagej

miniconda