找到 conda 放置我安装的 python 包的位置
Locate where conda placed a python package I installed
一个python
新手问题:
在 Ubuntu
系统上,我使用 sudo pip install
安装了 python
软件包。 (包名hlmm
)
我正在使用 miniconda3
环境,在我的 .bashrc
中指定的唯一 environment variable
是:
export PATH="/home/<my_username>/miniconda3/bin:$PATH"
现在我想 运行 我安装的包中的测试脚本,它位于相对于该包安装位置的 tests
文件夹下。
我用 pip list | xargs -exec pip show
寻找那个包裹的位置,但它没有出现。
我也在 python
中尝试导入包,使用:
import hlmm
我得到:
>>> import hlmm
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
ModuleNotFoundError: No module named 'hlmm'
如果我重做 sudo pip install hlmm
我得到:
Requirement already satisfied: hlmm in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages
Requirement already satisfied: scipy in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from hlmm)
Requirement already satisfied: numpy in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from hlmm)
Requirement already satisfied: pysnptools in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from hlmm)
Requirement already satisfied: pandas>=0.19.0 in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from pysnptools->hlmm)
Requirement already satisfied: pytz>=2011k in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from pandas>=0.19.0->pysnptools->hlmm)
Requirement already satisfied: python-dateutil>=2.5.0 in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from pandas>=0.19.0->pysnptools->hlmm)
Requirement already satisfied: six>=1.5 in /usr/lib/python2.7/dist-packages (from python-dateutil>=2.5.0->pandas>=0.19.0->pysnptools->hlmm)
而且,我确实在 /usr/local/lib/python2.7/dist-packages
下看到了 hlmm
文件夹,但找不到 tests
文件夹:
ls -1 /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/hlmm
__init__.py
__init__.pyc
hetlm.py
hetlm.pyc
hetlmm.py
hetlmm.pyc
如何找到它的位置?而且,尽管 import hlmm
错误,软件包真的安装成功了吗?
评论太长了,所以我post将其作为答案。
是的,听起来 pip
从您的 python 2.7 版本安装了它。您应该阅读此 post: and this article: https://www.anaconda.com/using-pip-in-a-conda-environment/ 来决定您要如何进行。我通常尽可能使用 conda
,如果 conda 没有构建,我通常使用 pip
。您可能想要 运行 pip uninstall hlmm
然后激活您的 conda env 并使用 pip3 install hlmm
。但是,我认为您应该在研究之后决定管理环境的最佳方式。
一个python
新手问题:
在 Ubuntu
系统上,我使用 sudo pip install
安装了 python
软件包。 (包名hlmm
)
我正在使用 miniconda3
环境,在我的 .bashrc
中指定的唯一 environment variable
是:
export PATH="/home/<my_username>/miniconda3/bin:$PATH"
现在我想 运行 我安装的包中的测试脚本,它位于相对于该包安装位置的 tests
文件夹下。
我用 pip list | xargs -exec pip show
寻找那个包裹的位置,但它没有出现。
我也在 python
中尝试导入包,使用:
import hlmm
我得到:
>>> import hlmm
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
ModuleNotFoundError: No module named 'hlmm'
如果我重做 sudo pip install hlmm
我得到:
Requirement already satisfied: hlmm in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages
Requirement already satisfied: scipy in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from hlmm)
Requirement already satisfied: numpy in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from hlmm)
Requirement already satisfied: pysnptools in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from hlmm)
Requirement already satisfied: pandas>=0.19.0 in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from pysnptools->hlmm)
Requirement already satisfied: pytz>=2011k in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from pandas>=0.19.0->pysnptools->hlmm)
Requirement already satisfied: python-dateutil>=2.5.0 in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from pandas>=0.19.0->pysnptools->hlmm)
Requirement already satisfied: six>=1.5 in /usr/lib/python2.7/dist-packages (from python-dateutil>=2.5.0->pandas>=0.19.0->pysnptools->hlmm)
而且,我确实在 /usr/local/lib/python2.7/dist-packages
下看到了 hlmm
文件夹,但找不到 tests
文件夹:
ls -1 /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/hlmm
__init__.py
__init__.pyc
hetlm.py
hetlm.pyc
hetlmm.py
hetlmm.pyc
如何找到它的位置?而且,尽管 import hlmm
错误,软件包真的安装成功了吗?
评论太长了,所以我post将其作为答案。
是的,听起来 pip
从您的 python 2.7 版本安装了它。您应该阅读此 post: conda
,如果 conda 没有构建,我通常使用 pip
。您可能想要 运行 pip uninstall hlmm
然后激活您的 conda env 并使用 pip3 install hlmm
。但是,我认为您应该在研究之后决定管理环境的最佳方式。