使用 setuptools 编译扩展模块的困难
difficulties using setuptools to compile extension module
我正在开发一个旨在通过 pip 安装的包(模块?)。该软件包包含一个 C++ 扩展,使用 pybind11 包装,link 用于其他一些库。
我能够编译 link 扩展库 手动 没有问题,但是我无法正确配置我的 setup.py
文件,这样调用 pip3 install my_package
.
时安装扩展模块
我一直在关注 this code(由 pybind11 文档 link 编辑)来配置我的 setup.py
文件,该文件包含在下面。
问题描述
为了完整起见,我的包目录如下所示:
my_package
|-setup.py
|-my_package
|-__init__.py
|-some_code.py
|-src
| my_extension.cpp
| some_header.h
我调用 pip3 install 如下:
pip3 install --user --upgrade --disable-pip-version-check . -vvv
(由于机器无法访问互联网,版本检查被禁用).
我可以从控制台的输出中看到 gcc 似乎被调用了,但我对输出的了解还不够,无法理解它是否被正确调用。 my_extension
似乎 构建没有任何错误:
building 'my_extension' extension
creating build/temp.linux-x86_64-3.7
creating build/temp.linux-x86_64-3.7/my_package
creating build/temp.linux-x86_64-3.7/my_package/src
gcc -pthread -Wno-unused-result -Wsign-compare -DDYNAMIC_ANNOTATIONS_ENABLED=1 -DNDEBUG -O2 -g -pipe -Wall -Werror=format-security -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wp,-D_GLIBCXX_ASSERTIONS -fexceptions -fstack-protector-strong -grecord-gcc-switches -m64 -mtune=generic -fasynchronous-unwind-tables -fstack-clash-protection -fcf-protection -D_GNU_SOURCE -fPIC -fwrapv -fPIC -I/usr/local/include/python3.7m -I/home/<my_user>/.local/include/python3.7m -I/usr/include/eigen3 -I/usr/include/python3.7m -c my_package/src/my_extension.cpp -o build/temp.linux-x86_64-3.7/my_package/src/my_extension.o -O3 -fPIC -march=native -DVERSION_INFO="0.0.1" -std=c++14 -fvisibility=hidden
但是,无论出于何种原因,python 解释器都无法找到 my_extension
。找到 src
子模块:
>>> from my_package import src
>>> src.__path__
['/home/<my_user>/.local/lib/python3.7/site-packages/my_package/src']
我可以看到它是空的:
>>> ls /home/<my_user>/.local/lib/python3.7/site-packages/my_package/src
__init__.py __pycache__
也就是说,这里似乎没有 my_extension.so
文件。
问题
下面的setup.py
有没有明显的问题?我很欣赏这是一个有点复杂的例子。
如果没有,我该如何进一步解决这个问题?我完全不知道如何进行。
我的setup.py
from setuptools import setup, Extension
from setuptools.command.build_ext import build_ext
import sys
import setuptools
__version__ = '0.0.1'
class get_pybind_include(object):
def __init__(self, user=False):
self.user = user
def __str__(self):
import pybind11
return pybind11.get_include(self.user)
ext_modules = [
Extension(
'my_extension',
['my_package/src/my_extension.cpp'],
include_dirs=[
get_pybind_include(),
get_pybind_include(user=True),
'/usr/include/eigen3'
],
language='c++'
),
]
def has_flag(compiler, flagname):
import tempfile
with tempfile.NamedTemporaryFile('w', suffix='.cpp') as f:
f.write('int main (int argc, char **argv) { return 0; }')
try:
compiler.compile([f.name], extra_postargs=[flagname])
except setuptools.distutils.errors.CompileError:
return False
return True
def cpp_flag(compiler):
if has_flag(compiler, '-std=c++14'):
return '-std=c++14'
elif has_flag(compiler, '-std=c++11'):
return '-std=c++11'
else:
raise RuntimeError('Unsupported compiler -- at least C++11 support is needed!')
class BuildExt(build_ext):
"""A custom build extension for adding compiler-specific options."""
c_opts = {
'msvc': ['/EHsc'],
'unix': [],
}
if sys.platform == 'darwin':
c_opts['unix'] += ['-stdlib=libc++', '-mmacosx-version-min=10.7']
def build_extensions(self):
ct = self.compiler.compiler_type
opts = self.c_opts.get(ct, [])
# extra compiler options
opts += [
'-O3',
'-fPIC',
'-march=native'
]
if ct == 'unix':
opts.append('-DVERSION_INFO="%s"' % self.distribution.get_version())
opts.append(cpp_flag(self.compiler))
if has_flag(self.compiler, '-fvisibility=hidden'):
opts.append('-fvisibility=hidden')
elif ct == 'msvc':
opts.append('/DVERSION_INFO=\"%s\"' % self.distribution.get_version())
for ext in self.extensions:
ext.extra_compile_args = opts
build_ext.build_extensions(self)
setup(
name='my_package',
version=__version__,
author='',
author_email='',
url='',
description='',
long_description='',
packages = setuptools.find_packages(),
ext_modules=ext_modules,
install_requires=['pybind11>=2.2'],
cmdclass={'build_ext': BuildExt},
zip_safe=False,
)
Extension('my_extension', …)
创建一个顶级扩展,您可以使用
导入
import my_extension
要使其成为您的包的子模块,请在包名称前添加:
Extension('my_package.my_extension', …)
我正在开发一个旨在通过 pip 安装的包(模块?)。该软件包包含一个 C++ 扩展,使用 pybind11 包装,link 用于其他一些库。
我能够编译 link 扩展库 手动 没有问题,但是我无法正确配置我的 setup.py
文件,这样调用 pip3 install my_package
.
我一直在关注 this code(由 pybind11 文档 link 编辑)来配置我的 setup.py
文件,该文件包含在下面。
问题描述
为了完整起见,我的包目录如下所示:
my_package
|-setup.py
|-my_package
|-__init__.py
|-some_code.py
|-src
| my_extension.cpp
| some_header.h
我调用 pip3 install 如下:
pip3 install --user --upgrade --disable-pip-version-check . -vvv
(由于机器无法访问互联网,版本检查被禁用).
我可以从控制台的输出中看到 gcc 似乎被调用了,但我对输出的了解还不够,无法理解它是否被正确调用。 my_extension
似乎 构建没有任何错误:
building 'my_extension' extension
creating build/temp.linux-x86_64-3.7
creating build/temp.linux-x86_64-3.7/my_package
creating build/temp.linux-x86_64-3.7/my_package/src
gcc -pthread -Wno-unused-result -Wsign-compare -DDYNAMIC_ANNOTATIONS_ENABLED=1 -DNDEBUG -O2 -g -pipe -Wall -Werror=format-security -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wp,-D_GLIBCXX_ASSERTIONS -fexceptions -fstack-protector-strong -grecord-gcc-switches -m64 -mtune=generic -fasynchronous-unwind-tables -fstack-clash-protection -fcf-protection -D_GNU_SOURCE -fPIC -fwrapv -fPIC -I/usr/local/include/python3.7m -I/home/<my_user>/.local/include/python3.7m -I/usr/include/eigen3 -I/usr/include/python3.7m -c my_package/src/my_extension.cpp -o build/temp.linux-x86_64-3.7/my_package/src/my_extension.o -O3 -fPIC -march=native -DVERSION_INFO="0.0.1" -std=c++14 -fvisibility=hidden
但是,无论出于何种原因,python 解释器都无法找到 my_extension
。找到 src
子模块:
>>> from my_package import src
>>> src.__path__
['/home/<my_user>/.local/lib/python3.7/site-packages/my_package/src']
我可以看到它是空的:
>>> ls /home/<my_user>/.local/lib/python3.7/site-packages/my_package/src
__init__.py __pycache__
也就是说,这里似乎没有 my_extension.so
文件。
问题
下面的
setup.py
有没有明显的问题?我很欣赏这是一个有点复杂的例子。如果没有,我该如何进一步解决这个问题?我完全不知道如何进行。
我的setup.py
from setuptools import setup, Extension
from setuptools.command.build_ext import build_ext
import sys
import setuptools
__version__ = '0.0.1'
class get_pybind_include(object):
def __init__(self, user=False):
self.user = user
def __str__(self):
import pybind11
return pybind11.get_include(self.user)
ext_modules = [
Extension(
'my_extension',
['my_package/src/my_extension.cpp'],
include_dirs=[
get_pybind_include(),
get_pybind_include(user=True),
'/usr/include/eigen3'
],
language='c++'
),
]
def has_flag(compiler, flagname):
import tempfile
with tempfile.NamedTemporaryFile('w', suffix='.cpp') as f:
f.write('int main (int argc, char **argv) { return 0; }')
try:
compiler.compile([f.name], extra_postargs=[flagname])
except setuptools.distutils.errors.CompileError:
return False
return True
def cpp_flag(compiler):
if has_flag(compiler, '-std=c++14'):
return '-std=c++14'
elif has_flag(compiler, '-std=c++11'):
return '-std=c++11'
else:
raise RuntimeError('Unsupported compiler -- at least C++11 support is needed!')
class BuildExt(build_ext):
"""A custom build extension for adding compiler-specific options."""
c_opts = {
'msvc': ['/EHsc'],
'unix': [],
}
if sys.platform == 'darwin':
c_opts['unix'] += ['-stdlib=libc++', '-mmacosx-version-min=10.7']
def build_extensions(self):
ct = self.compiler.compiler_type
opts = self.c_opts.get(ct, [])
# extra compiler options
opts += [
'-O3',
'-fPIC',
'-march=native'
]
if ct == 'unix':
opts.append('-DVERSION_INFO="%s"' % self.distribution.get_version())
opts.append(cpp_flag(self.compiler))
if has_flag(self.compiler, '-fvisibility=hidden'):
opts.append('-fvisibility=hidden')
elif ct == 'msvc':
opts.append('/DVERSION_INFO=\"%s\"' % self.distribution.get_version())
for ext in self.extensions:
ext.extra_compile_args = opts
build_ext.build_extensions(self)
setup(
name='my_package',
version=__version__,
author='',
author_email='',
url='',
description='',
long_description='',
packages = setuptools.find_packages(),
ext_modules=ext_modules,
install_requires=['pybind11>=2.2'],
cmdclass={'build_ext': BuildExt},
zip_safe=False,
)
Extension('my_extension', …)
创建一个顶级扩展,您可以使用
import my_extension
要使其成为您的包的子模块,请在包名称前添加:
Extension('my_package.my_extension', …)