如何将包含多个表的 .dat 文件读取到 pandas 数据框中？

Question

我有一个测量设备，在.dat文件中记录数据，如raw_data.dat在this folder，都具有相同的结构，我希望能够提取最后一个table 在文件中放入 pandas 数据框。

该文件有几个 table，我不确定这里的制表结构是否是 .dat 文件的标准，但我尝试将文本粘贴到 excel 中，它识别文本作为单独的 table，因此可能有一种相当标准的方法可以将结构正确读入 python。我找不到一个，所以我尝试了一种非常复杂的方法，将 .dat 文件读入一个字符串，然后手动切掉部分文件的顶部并将其余部分保存为 .dat 文件。我的希望是以某种方式能够将结果保存为 .csv 或 .xls，但我仍然找不到如何做到这一点。此外，导入后制表被转换为 \t's，这不会返回到保存文件中的制表。我的代码如下


mylines = []                             
with open ('raw_file.dat', 'rt') as myfile:
    for myline in myfile:
        mylines.append(myline)

string = (mylines[8:])

with open("updated.dat", "w") as output:
    output.write(str(string))

我必须承认我是 python 的新手，我不确定我是否正确使用了这些功能。不过，我希望有比我正在尝试的解决方法更直接的方法来解决这个问题。

Answer 1

如果您可以确定您想要的第三个 table 从第 8 行开始，那么您没有理由让它比从第 8 行开始索引文件更复杂。从那里，您可以使用字符串操作和列表理解来清理数据：

import pandas as pd

# Read the data.
with open('raw_data.dat', 'r') as fh:
    lines = fh.readlines()[8:]

# Remove newlines, tabs, and split each string separated by spaces.
clean = [line.strip.replace('\t', '').split() for line in lines]

# Feed the data into a DataFrame.
data = pd.DataFrame(clean[1:], columns=clean[0])

输出：

               Time         Variab1e1  ...               v18               v19
0  +0.00000000e+000  +3.04142181e-002  ...  +0.00000000e+000  +0.00000000e+000
1  +1.00000000e+000  +1.96144191e-001  ...  +1.00000000e+000  +0.00000000e+000
2  +2.00000000e+000  +3.75599731e-001  ...  +2.00000000e+000  +0.00000000e+000

如果要将值转换为浮点数，可以在将数据转换为 DataFrame 之前执行此操作：

headers = clean[0]
rows = [[float(value) for value in row] for row in clean[1:]]

data = pd.DataFrame(rows, columns=headers)

这让你的框架更清晰：

   Time  Variab1e1  Variable2  Variable3  Variable4  ...  v15  v16   v17  v18  v19
0   0.0   0.030414        0.0   1.383808        0.0  ...  0.0  0.0  15.0  0.0  0.0
1   1.0   0.196144        1.0   7.660262        1.0  ...  0.0  1.0  15.0  1.0  0.0
2   2.0   0.375600        2.0  15.356726        2.0  ...  0.0  2.0  15.0  2.0  0.0

如何将包含多个表的 .dat 文件读取到 pandas 数据框中？

How can I read .dat file containing multiple tables into a pandas data frame?

python

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