更改 class 并获取数字

Question

我正在使用 R 中的 golub 数据集（由 AML 和 ALL 分隔），我正在尝试对两个基因进行假设检验。对于 AML 患者组，我想找出与基因 1000 相比基因 900 表达更高的患者比例，然后我想看看在基因 900 表达值更高的患者中，是否有数量不到一半。我有一个大致的想法来做另一半，第一部分我有类似的东西，但看到它 T/F 我试图将它切换到给出 0 和 1 的数字，但我想要实际数字和不是逻辑形式。

`gol.fac <- factor(golub.cl,levels=0:1, labels= c("ALL","AML"))
 x <- golub[900,gol.fac=="AML"]
 y <- golub[1000,gol.fac=="AML"]
 z <-golub[900,gol.fac=="AML"] > golub[1000,gol.fac=="AML"]
 k <- as.numeric(z)`

Answer 1

使用max

max(golub[900,gol.fac=="AML"], golub[1000,gol.fac=="AML"])

或者如果您有多个值，则使用 pmax

pmax(golub[900,gol.fac=="AML"], golub[1000,gol.fac=="AML"])

Answer 2

无需对行进行多切片，只需通过子集化一次

即可获得max

max(golub[900:1000, "AML"])

更改 class 并获取数字

changing class and getting numbers

logic

r

numeric

dataset

hypothesis-test