我：在 Matlab 中执行 imageJ (Fiji) 宏直到结束

Question

我正在使用 MIJ 在 Matlab 中执行 ImageJ 宏。该宏必须在 "for" 循环中执行多次。问题是 Matlab 不会等到宏结束。最初我用 "while" 循环解决了这个问题，检查从宏生成的 "Results" table 是否为空。但是，它只是第一次解决了问题，然后从第二次开始 "Results" table 不再是空的了。我也想过在宏的末尾生成一个变量，并用它来检查宏是否完成，但我不知道如何在 Matlab 中读取它。

你对我如何解决这个问题有什么建议吗？

非常感谢，阿莱西亚

这是我的代码示例：

javaaddpath 'C:/Program Files/MATLAB/R2019a_x64/java/ij.jar'
javaaddpath 'C:/Program Files/MATLAB/R2019a_x64/java/mij.jar'
MIJ.start('C:/fiji-win64/Fiji.app/plugins');

IJ=ij.IJ(); 

macro_path=... 
'C:/Macro_waterinoil.ijm'; 
for pos=1:16
    im = mijread(strcat('E:/droplets.tif'));
    figure(1)
    imshow(im,[0 255])

   IJ.runMacroFile(java.lang.String(macro_path)); 

    res_Hough=0;  
    res_Hough=MIJ.getResultsTable();


    while res_Hough==0;   
        res_Hough=MIJ.getResultsTable();        
    end

    im_res=MIJ.getCurrentImage();

    MIJ.run('Clear Results');
    MIJ.run('Close All');
end

Answer 1

编辑：忽略下面的内容，我走在正确的轨道上，但没有给予应有的关注。我认为这个问题是在您将 res_Hough 设置为 0 之后的行（即 res_Hough=MIJ.getResultsTable();）。尝试删除它，以便下一行是 while 循环，然后我们可以检查输出，看看下面是否也适用

如果我没理解错的话，您是在使用 while 循环不断 ping 直到 table 已满，然后将这些值存储在 res_Hough 中，对吗？我想知道这是否是 ImageJ/FIJI 固有的限制。我认为可能是这种情况的原因是，对您的问题的一个非常简单的解释是 table 保留了以前的值，因此在第一个循环之后将始终为满，除非以某种方式手动清除。你认为会是这样吗？也许在 while 循环之后添加一个 print 语句，看看它是否在 for 循环期间打印相同的值。

我想接下来要做的就是不管上述情况如何，我都要真正尝试提供一个解决方案。我的想法是尝试让 while 循环检查前一次迭代的 table 值，直到它们不同，然后存储更新后的值。那有意义吗？类似于：

while (res_Hough[i]==0) or (res_Hough[i-1]==MIJ.getResultsTable());
    res_Hough[i]=MIJ.getResultsTable();

其中 i 通过 for 循环递增

我：在 Matlab 中执行 imageJ (Fiji) 宏直到结束

MIJ: execute imageJ (Fiji) macro until end in Matlab

matlab

imagej

imagej-macro