尝试编译 HPCC 基准时无法 link 到 BLAS/ATLAS

Question

我正在尝试在小型 RHEL 桌面上编译 HPCC 基准测试。在 linking 之前一切似乎都很好。我的 link 命令是

    mpicc -DAdd_ -DF77_INTEGER=int -DStringSunStyle  -I../../../include \
 -I../../../include/myarch -I/path/to/my/ATLAS_build/include \
-I/usr/include/openmpi-x86_64 -fomit-frame-pointer -O3 -funroll-loops \
-W -Wall -lm -o ../../../../hpcc ../../../lib/bugzilla/libhpl.a \
/path/to/my/ATLAS_build/lib/libcblas.a \
/path/to/my/ATLAS_build/lib/libatlas.a -L/usr/lib64/openmpi/lib

link 失败并出现几个错误，所有错误都与 link 用户找不到的 BLAS/ATLAS 对象有关。其中一些是：

../../../lib/myarch/libhpl.a(HPL_dcopy.o): In function `HPL_dcopy':
HPL_dcopy.c:(.text+0x1e): undefined reference to `dcopy_'
../../../lib/myarch/libhpl.a(HPL_daxpy.o): In function `HPL_daxpy':
HPL_daxpy.c:(.text+0x2f): undefined reference to `daxpy_'
../../../lib/myarch/libhpl.a(HPL_dscal.o): In function `HPL_dscal':
HPL_dscal.c:(.text+0x22): undefined reference to `dscal_'
../../../lib/myarch/libhpl.a(HPL_idamax.o): In function `HPL_idamax':
HPL_idamax.c:(.text+0x1a): undefined reference to `idamax_'
../../../lib/myarch/libhpl.a(HPL_dgemv.o): In function `HPL_dgemv':
HPL_dgemv.c:(.text+0xba): undefined reference to `dgemv_'
HPL_dgemv.c:(.text+0x136): undefined reference to `dgemv_'

这是我真的不明白的地方。以 dgemv 为例。 libhpl.a 确实调用了它：

>$ nm libhpl.a | grep dgemv
HPL_dgemv.o:
                 U dgemv_

现在，libcblas.a 有对它的引用，但需要 ATLAS 中的版本：

>$ nm libcblas.a | grep dgemv
cblas_dgemv.o:
                 U ATL_dgemv

最后，ATLAS有没有ATL_dgemv？

ATL_dgemv.o:
0000000000000000 T ATL_dgemv

所以，是的，确实如此。所以 CBLAS 有一个 dgemv HPCC 应该（我认为）能够插入，但它需要 ATL_dgemv。但是 ATLAS 有 ATL_dgemv。那么，为什么 link 人找不到 HPCC 所需的一切？

谢谢。

Answer 1

您的日志表明 libhpl.a 需要 dgemv_ 符号，而 libcblas.a 和 libatlas.a 均未提供（我假设您的最后一条命令是 nm libatlas.a | grep dgemv).

dgemv_ 中的尾部下划线强烈表明它需要 Fortran BLAS（而不是 C BLAS）库，因此您只需将 libcblas.a 替换为 libblas.a.

IIRC，另一种选择是调整 HPL 配置并指示它使用 cblas 而不是 (Fortran) BLAS。

尝试编译 HPCC 基准时无法 link 到 BLAS/ATLAS

Cannot link to BLAS/ATLAS when trying to compile HPCC benchmark

c

mpi

blas

atlas