如何访问 R 中的嵌套 SQL 表？

Question

从 R Studio 的 ODBC database documentation 我可以看到一个简单的例子，说明如何将 SQL table 读入 R 数据框：

data <- dbReadTable(con, "flights")

让我粘贴一张 BGBUref table(?) 我正在尝试读取到 R 数据框的图形。这是我在 R studio 中的连接窗格。

如果我使用与上面相同的语法，其中 con 是我的 dbConnect(...) 的输出，我得到以下内容：

df <- dbReadTable(con, "BGBURef")
#> Error: <SQL> 'SELECT * FROM "BGBURef"' nanodbc/nanodbc.cpp:1587: 42S02: 
#> [Microsoft][ODBC Driver 17 for SQL Server][SQL Server]Invalid object name
#> 'BGBURef'.

我对"table"的理解有误吗？或者我需要做这样的事情才能到达嵌套的 BGBUref table:

df <- dbReadTable(con, "QnRStore\dbo\BGBURef")
#> Error: '\d' is an unrecognized escape in character string starting ""QnRStore\d"

如果我单击小电子表格图标，BGBUref 数据框将出现在 R Studio 中。我只是不知道如何将它放入定义的数据框中，在我的例子中 df.

这是我运行这些命令时的输出：

df <- dbReadTable(con, "QnRStore")
#> Error: <SQL> 'SELECT * FROM "QnRStore"'
#> nanodbc/nanodbc.cpp:1587: 42S02: [Microsoft][ODBC Driver 17 for SQL 
#> Server][SQL Server]Invalid object name 'QnRStore'.

和：

dbListTables(con)
#>  [1] "spt_fallback_db"                                         
#>  [2] "spt_fallback_dev"                                        
#>  [3] "spt_fallback_usg"                                        
#>  [4] "spt_monitor"                                             
#>  [5] "trace_xe_action_map"                                     
#>  [6] "trace_xe_event_map"                                      
#>  [7] "spt_values"                                              
#>  [8] "CHECK_CONSTRAINTS"                                       
#>  [9] "COLUMN_DOMAIN_USAGE"                                     
#> [10] "COLUMN_PRIVILEGES" 
#> ...
#> [650] "xml_schema_types"                                        
#> [651] "xml_schema_wildcard_namespaces"                          
#> [652] "xml_schema_wildcards"

Answer 1

当使用 dbplyr 时，似乎

df = tbl(con, from = 'BGBUref')

如果大致相当于

USE QnRStore
GO

SELECT * FROM BGBUref;

来自@David_Browne的评论和您拥有的图片：

一个 table 名为 'BGBUref'
在名为 'dbo'
在名为 'QnRStore'

在这种情况下，您需要 in_schema 命令。

如果您的连接 (con) 是 QnRStore 数据库，那么试试这个：

df = tbl(con, from = in_schema('dbo', 'BGBUref'))

如果您的连接 (con) 不是直接连接到 QnRStore 数据库，那么这可能有效：

df = tbl(con, from = in_schema('QnRStore.dbo', 'BGBUref'))

（我在通过同一连接访问多个数据库时使用这种形式。因为如果在来自不同数据库的 table 之间连接时使用相同的连接，dbplyr 性能最佳。）

Answer 2

一般背景

首先，请考虑阅读关系数据库体系结构，其中 tables 封装在模式中，模式本身封装在数据库中，然后再封装在服务器或集群中。请注意图像中的图标对应于对象类型：

cluster/server < catalog/database < schema/namespace < table

因此，在您的情况下没有嵌套 tables，而是典型的架构：

myserver < QnRStore < dbo < BGBURef

要在 SQL 查询中从服务器级别访问此体系结构，您将使用符合句点的名称：

SELECT * FROM database.schema.table

SELECT * FROM QnRStore.dbo.BGBURef

SQL 服务器的默认架构是 dbo（相比之下，Postgres 是 public）。通常，像 R 的 odbc 这样的 DB-API 连接到一个数据库，该数据库允许连接到任何底层模式和相应的 tables，假设连接的用户可以访问此类模式。请注意，此规则不可推广。例如，Oracle 的架构与所有者对齐，MySQL 的数据库与架构同义。

进一步阅读：

What is the difference between a schema and a table and a database?
Differences between Database and Schema using different databases?
Difference between database and schema
What's the difference between a catalog and a schema in a relational database?

具体案例

因此，要连接到默认架构中的 SQL 服务器数据库 table，只需引用 table、BGBURef，它假定 table ] 驻留在连接数据库的 dbo 架构中。

df <- dbReadTable(con, "BGBURef")

如果您使用非默认模式，您将需要相应地指定它，最近您可以使用 DBI::Id 来指定它，并且可以类似地用于 dbReadTable 和 dbWriteTable：

s <- Id(schema = "myschema", table = "mytable")

df <- dbReadTable(con, s)

dbWriteTable(conn, s, mydataframe)

或者，您可以运行所需的期间限定 SQL 查询：

df <- dbGetQuery(con, "SELECT * FROM [myschema].[mytable]")

并且您可以使用 SQL() 写入持久性 tables:

dbWriteTable(con, SQL("myschema.mytable"), mydataframe)

如何访问 R 中的嵌套 SQL 表？

How do I access nested SQL tables in R?

r

sql-server

odbc

r-dbi

dbplyr