使用丰度数据生成全球海洋热图

Question

我有全球海洋中不同地理位置的物种丰度。我想生成一个热图，用颜色渐变显示我的物种的丰度。 Here is the header of the data

R 或 R 代码中是否有任何包可以帮助我将其可视化为热图（地理）？

提前致谢

Answer 1

leaflet 真的很强大，真心推荐图书馆

这是一个例子：

> library(leaflet)
> fishes <- data.frame(lat=c(-47.2,-20.4,-20.9),long=c(-57.9,-3.2,-35.2),abudance=c(5,1,17),samples=c("s1","s2","s3"))
> fishes
    lat  long abudance samples
1 -47.2 -57.9        5      s1
2 -20.4  -3.2        1      s2
3 -20.9 -35.2       17      s3

> leaflet(fishes) %>% addTiles() %>%
+     addCircles(lng = ~long, lat = ~lat, weight = 1,
+                radius = ~abudance *20000, popup = ~samples
+     ) %>% addTiles() %>% addMarkers(~long, ~lat, popup = ~as.character(abudance), label = ~as.character(abudance))

以上代码将生成：

要自定义弹出窗口和点，请参阅这些页面：

https://rstudio.github.io/leaflet/markers.html

https://rstudio.github.io/leaflet/popups.html

https://rstudio.github.io/leaflet/colors.html

使用丰度数据生成全球海洋热图

generate Global oceanic heatmap with abundance data

r

plot

heatmap

geography