在哪里可以找到用于生成 snakemake 报告的文件 workflow.rst 的示例？

Question

我正在尝试使用此处记录的 snakemake 的报告功能： https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/snakefiles/reporting.html

但是我发现很难找到一个有意义的例子来说明 workflow.rst 文件应该是什么样子。

我看过输出示例 https://koesterlab.github.io/resources/report.html

但我找不到生成此报告的代码。

Answer 1

文档中的link好像有问题

我在snakemake的测试中找到了一个例子：

https://github.com/snakemake/snakemake/tree/master/tests/test_report

生成报告的 snakefile 在那里： https://github.com/snakemake/snakemake/blob/master/tests/test_report/Snakefile

它使用以下 .rst 文件： https://github.com/snakemake/snakemake/blob/master/tests/test_report/report/workflow.rst