R - `:=`（变量，as.character（变量））中的错误

Question

我正在尝试运行一个 R 脚本，可以使用命令 here 找到它 plot_trace.R -m ./log.model.csv ./log.trace.csv.

可以找到两个csv文件here。

这会产生错误：

Error in `:=`(variable, as.character(variable)) : 
  Check that is.data.table(DT) == TRUE. Otherwise, := and `:=`(...) are defined for use in j, once only and in particular ways. See help(":=").
Calls: [ -> [.tbl_df -> check_names_df -> :=

最后但并非最不重要的是我的 sessionInfo() 输出：

R version 3.4.4 (2018-03-15)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 18.04.3 LTS

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.7.1
LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.7.1

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.4.4

谢谢

Answer 1

看起来 unnest 调用正在创建一些非数据 table 的东西。

在第 56 行尝试添加：

trace.df <- as.data.table(trace.df)

Answer 2

更新

我发现这个脚本有两个问题：

作者混合了 tidyr 的函数和 class data.table 的变量。这些函数可能会 return 数据帧，并且在这些函数上使用 data.table 语法会导致错误。不幸的是，某些 tidyr 函数在一个函数上运行时可能 return data.table，但这似乎因 tidyr 包的版本而有很大差异。
tidyr 中的 unnest 函数有一个新界面。该脚本无法像 tidyr 版本 1.0.0 或更高版本那样工作。

下面是我为修复脚本而更改的行，使用 R 版本 3.6.1 和 tidyr 版本 1.0.0:

第 56 行： 添加了 trace.df <- as.data.table(trace.df)
第 64 行： 更改为 trace.df <- unnest(trace.df, cols)
第 65 行： 添加了 trace.df <- as.data.table(trace.df)

原回答

我能够运行您提供的数据的脚本没有错误。两者

Rscript --vanilla plot_trace.R -m ./log.model.csv ./log.trace.csv

和

chmod +x plot_trace.R
./plot_trace.R -m ./log.model.csv ./log.trace.csv

产生了以下情节：

你能在 RStudio 中运行脚本一步一步地检查每一步后 trace.df 的 class 吗？

R - `:=`（变量，as.character（变量））中的错误

R - Error in `:=`(variable, as.character(variable))

r

data.table

colon-equals