缺少可选依赖项 'tables'。在 pandas to_hdf

Question

• 以下代码出现错误。

import pandas as pd
df = pd.DataFrame({'a' : [1,2,3]})
df.to_hdf('temp.h5', key='df', mode='w')

• 这是我的错误。

  Missing optional dependency 'tables'. Use pip or conda to install tables.

• 我已经试过了 ImportError HDFStore requires PyTables No module named tables。还是一样的错误。

• 我在读取 hdf 文件时遇到同样的错误。我的 python.

已经安装了 tables

一些版本信息。

• python 3.7.4
• pandas 0.25.2
• windows10

PS：您可以在 repl https://repl.it/ 中重现此内容。

更新:

• 我试过运行以下。

import tables

并收到此错误：

ImportError: Could not load any of ['hdf5.dll', 'hdf5dll.dll'], please ensure that it can be found in the system path.

• 看起来 pandas 没有给出准确的信息。它只是在实际存在时说缺少依赖性。

• 如果有人知道如何解决这个问题。这会有所帮助。

Answer 1

• 问题出在 tables。
• 当我使用 pip 安装 tables 到本地用户目录时，使用以下命令它不起作用。

pip install --user tables

• 运行 import tables 将导致此错误。

  ImportError: Could not load any of ['hdf5.dll', 'hdf5dll.dll'], please ensure that it can be found in the system path

• 对我有用的解决方案是卸载表。并将其安装到 python 的目录中。 （或安装 python 的位置）。 without --user option。根据您 python.

的位置，您可能需要 admin/root 访问权限
• 对我来说，我的 python 路径是 C:\Program Files\Python37-64\python.exe 并且在 c:\program files\python37-64\lib\site-packages\ 下安装对我有用。
• 希望这对您有所帮助。我不知道为什么在用户目录中安装不适用于表。如果有人能找到原因，请在此处 post。

Answer 2

conda 用户：

conda install pytables

Answer 3

我使用

让它工作

conda install snappy

Answer 4

以上解决方案对我不起作用。可能是因为我使用conda-forge通道构建了个人环境，所以我成功了：

conda install -c conda-forge pytables

Answer 5

我在使用 pip install -U -r requirements.txt 刷新现有的 conda 虚拟环境时出现了这个问题。我按如下方式解决了这个问题：

1. conda env remove -n <env> # remove your virtual env.
2. conda create -n <env> python==3.8 # create your virtual env again.
3. pip install -U -r requirements.txt

混合维护 conda 和 pip 包非常乏味，所以我只使用后者。

Answer 6

我使用表 3.6.1 解决了依赖关系

pip install tables==3.6.1