用于可视化分层网络和评估从网络中删除节点的影响的工具

Question

一直在使用 NetworkX 可视化系统之间的数据流。这很好用，但可视化看起来有点乏味，另外我想与网络交互，做一些事情，比如删除节点或 "inspect" 节点。我也尝试过 Power BI 和 Gephi 等工具，但它们都有问题。

有哪些 BI Tools/Python 库等可以有效地可视化有向网络图并与之交互？

Answer 1

您有两个问题应该分开处理：可视化和交互性。

可视化：

NetworkX 有一些工具可以有效地可视化层次图。他们正在使用 Graphviz library and pygraphviz/pydot 界面。这是示例：

import networkx as nx

# Create the hierarchical graph (DAG)
G = nx.fast_gnp_random_graph(70, 0.02)
G.remove_edges_from([(x, y) for (x, y) in G.edges if x > y])
G = nx.subgraph(G, max(nx.connected_components(G), key=lambda x: len(x)))

# Draw it with default function
nx.draw(G, node_size=50)

# Draw it with graphviz_layout
nx.draw(G, node_size=50, pos=nx.nx_agraph.graphviz_layout(G, prog='dot'))

如果您想使用 Graphviz 本身可视化您的图表，您可以convert it to DOT file并在以后使用 Graphviz 的全部功能。

您还可以使用 Javascript 库，如 Bokeh or D3.js 以稍微更具交互性的方式绘制您的 NetworkX 图（您可以交互地 select 节点，突出显示这些中的边和其他一些东西库）.

互动性：

这个问题远比可视化问题复杂。 Python 没有稳定的流行 libraries/programs 可以让您在交互式 GUI 中操作图形。交互性需要非常复杂的软件，而 Python 却没有。

最适合您的软件是：

Gephi（它没有层次图的默认可视化，但您可以下载一个插件来实现）。
Cytoscape - 也许它比 Gephi 更适合你。
Wolfram Mathematica - 不错，但要花钱。

用于可视化分层网络和评估从网络中删除节点的影响的工具

Tools for visualizing hierarchical networks, and assessing impact of removing nodes from the network

data-visualization

hierarchy

networkx