如何更改 Cytoscape 中选定节点的大小？
How to change sizes of selected nodes in Cytoscape?
我想在 Cytoscape 应用程序中更改所选节点的大小。
另外，对于大型网络，手动选择非常繁琐，那么是否也可以将源节点和目标节点的大小设置不同？
有几种方法可以在 Cytoscape 中设置 selected 节点的大小：
- 编辑 select 时，您可以打开样式选项卡并为节点大小（设置的第三列）设置 "bypass" 值。这将覆盖任何默认值或映射值（前两列）。
- 在 selected 期间，您可以创建一个新节点 Table 列（加号图标）。例如，将其设为字符串或布尔值。然后为其中一行输入一个值，然后右键单击它并选择 "Apply to all selected rows"。这将用相同的值填充所有 selected 节点。现在您可以在样式面板中使用节点大小映射。这种方法是首选，因为 selection 现在由节点 Table 列永久指示，并且会 save/export/convert 更好。
- 您还可以在 table 中定义 select（例如，在 Excel 中），其中包含一列节点名称和一个新列（就像您在选项 2)。然后只需导入 table.
- 如果你喜欢 R 也可以使用 RCy3...
关于大小源和目标：Cytoscape 的样式窗格无法访问此模型信息。最好的方法可能是上面的#3。您可能已经在 Cytoscape 之外定义了 table 源节点和目标节点。您可以使用它来创建显式 table 列，然后创建到节点大小的映射。
希望对您有所帮助！
我想在 Cytoscape 应用程序中更改所选节点的大小。 另外，对于大型网络，手动选择非常繁琐，那么是否也可以将源节点和目标节点的大小设置不同？
有几种方法可以在 Cytoscape 中设置 selected 节点的大小：
- 编辑 select 时，您可以打开样式选项卡并为节点大小（设置的第三列）设置 "bypass" 值。这将覆盖任何默认值或映射值（前两列）。
- 在 selected 期间，您可以创建一个新节点 Table 列（加号图标）。例如，将其设为字符串或布尔值。然后为其中一行输入一个值，然后右键单击它并选择 "Apply to all selected rows"。这将用相同的值填充所有 selected 节点。现在您可以在样式面板中使用节点大小映射。这种方法是首选，因为 selection 现在由节点 Table 列永久指示，并且会 save/export/convert 更好。
- 您还可以在 table 中定义 select（例如，在 Excel 中），其中包含一列节点名称和一个新列（就像您在选项 2)。然后只需导入 table.
- 如果你喜欢 R 也可以使用 RCy3...
关于大小源和目标：Cytoscape 的样式窗格无法访问此模型信息。最好的方法可能是上面的#3。您可能已经在 Cytoscape 之外定义了 table 源节点和目标节点。您可以使用它来创建显式 table 列，然后创建到节点大小的映射。
希望对您有所帮助！