强制 ggsave 对 .wmf-files 中的点 geom 进行矢量化
Force ggsave to vectorize point geoms in .wmf-files
用 R 生成的图如果不能正确导出则不能用于发布。我在 Windows 机器上工作,并使用 MS Word 2016 进行所有写作。所以,我希望将我的绘图导出为 .wmf 文件(我想 .emf 也可以)。
我用 ggplot2
生成所有图表,所以我想 ggsave (device = "wmf")
似乎是个不错的选择。但是,我对生成的文件有一个主要问题:点 geom 似乎打印为光栅格式而不是矢量格式。这是生成简单散点图的示例:
library (ggplot2)
plot_data <- data.frame (a = runif (1:20),
b = seq (1:20))
x11 (width = 3, height = 3)
ggplot (data = plot_data, mapping = aes (x = a, y = b)) +
geom_point () +
labs (x = "my x-label", y = "my y-label") +
theme (panel.background = element_blank(),
panel.border = element_rect (fill = NA, size = 0.7),
axis.ticks = element_line (color = "black", lineend = "round"),
axis.ticks.length = unit (2, "mm"),
axis.text = element_text (color = "black"),
plot.margin = unit(rep (0, 4), "cm")
)
我用以下代码保存情节:
ggsave(filename = "my_file.wmf", device = "wmf")
当我在 MS Word 或 Libre Office 中打开绘图时,我发现这些点的渲染质量根本不高。在 Libre Office Draw 中,一个点看起来像这样(放大了很多):
在 MS Word 中,绘图如下所示:
这些 "points":
然而,标签和坐标轴没问题。微软字:
自由办公室抽奖:
我假设标签、刻度注释和轴(甚至围绕点的圆圈)以矢量格式存储,而点几何似乎存储为栅格。恐怕生成的图不可用。所以,我想找到一个选项来强制 ggsave ()
向量化点 geom 而不是打印光栅。我非常希望有人能提供帮助——我迫切需要一种简单的方法来从 R 中导出绘图以供发布,以说服我的实验室更多地依赖 R。
我没有找到使 WMF 设备正常运行的方法,但您可以保存为 SVG,然后使用 R 通过 Inkscape(您需要单独下载的免费软件)自动从 SVG 转换为 EMF,如下所示:
inkscape_path <-'C:/Program Files/Inkscape/inkscape.exe'
if(!file.exists(inkscape_path)) {
warning("Could not find inkscape, will not convert to .emf")
} else {
input_file <- "plot.svg"
output_file <- "plot.emf"
system(paste0('"', inkscape_path,'"', ' --file "', input_file, '" --export-emf "', output_file, '"'))
}
(Inkscape 不支持从命令行导出到 WMF,但为了导入 int Office,WMF 和 EMF 应该可以互换)
编辑: 不幸的是,您无法从命令行访问某些导出设置(特别是 "convert text to paths" 选项)。但是,命令行将使用您上次用于导出 WMF 的设置,因此您可以使用所需设置手动保存一次并自动进行进一步的转换。 (这是一个已知的限制:https://bugs.launchpad.net/inkscape/+bug/1747696)
您可以使用附加 CRAN 包 devEMF 在 R 中直接创建完全矢量化的 EMF(或 EMF+)文件。这避免了导出为 SVG 并随后转换为 EMF 的任何需要。我不确定为什么 ggsave(..., device="wmf")
调用(使用 window API 生成文件)在这里使用光栅绘图符号,但 devEMF 中的函数肯定使用向量(我说这既是 devEMF 的开发者,也是通过放大 LibreOffice 确认的。
安装 devEMF 后,您可以 运行 原始问题中的示例代码,然后:
library(devEMF)
ggsave(filename = "my_file.emf", device = emf)
注意:上面代码中使用的emf
(不带引号)是devEMF定义的一个函数的名称(类似于x11
中使用的原始问题)。 "emf"
(带引号)将被 ggsave 解释为使用 windows API 的请求。你想要前者不带引号,而不是后者带引号。
或者,可以替换对 x11
的原始调用,直接生成 emf 文件,无需 ggsave
:
library (ggplot2)
library (devEMF)
plot_data <- data.frame (a = runif (1:20),
b = seq (1:20))
emf (file = "my_file.emf", width = 3, height = 3)
ggplot (data = plot_data, mapping = aes (x = a, y = b)) +
geom_point () +
labs (x = "my x-label", y = "my y-label") +
theme (panel.background = element_blank(),
panel.border = element_rect (fill = NA, size = 0.7),
axis.ticks = element_line (color = "black", lineend = "round"),
axis.ticks.length = unit (2, "mm"),
axis.text = element_text (color = "black"),
plot.margin = unit(rep (0, 4), "cm")
)
dev.off() #must close device to close file!
根据我的经验,MS Office 对 EMF 和 EMF+ 的支持与 WMF 一样完整,因此生成 EMF 是此用例的合理解决方案。如果您 运行 遇到兼容性问题,请查看 emf
函数的 emfPlus* 参数(参见 help("emf", package="devEMF")
)。
用 R 生成的图如果不能正确导出则不能用于发布。我在 Windows 机器上工作,并使用 MS Word 2016 进行所有写作。所以,我希望将我的绘图导出为 .wmf 文件(我想 .emf 也可以)。
我用 ggplot2
生成所有图表,所以我想 ggsave (device = "wmf")
似乎是个不错的选择。但是,我对生成的文件有一个主要问题:点 geom 似乎打印为光栅格式而不是矢量格式。这是生成简单散点图的示例:
library (ggplot2)
plot_data <- data.frame (a = runif (1:20),
b = seq (1:20))
x11 (width = 3, height = 3)
ggplot (data = plot_data, mapping = aes (x = a, y = b)) +
geom_point () +
labs (x = "my x-label", y = "my y-label") +
theme (panel.background = element_blank(),
panel.border = element_rect (fill = NA, size = 0.7),
axis.ticks = element_line (color = "black", lineend = "round"),
axis.ticks.length = unit (2, "mm"),
axis.text = element_text (color = "black"),
plot.margin = unit(rep (0, 4), "cm")
)
我用以下代码保存情节:
ggsave(filename = "my_file.wmf", device = "wmf")
当我在 MS Word 或 Libre Office 中打开绘图时,我发现这些点的渲染质量根本不高。在 Libre Office Draw 中,一个点看起来像这样(放大了很多):
在 MS Word 中,绘图如下所示:
这些 "points":
然而,标签和坐标轴没问题。微软字:
自由办公室抽奖:
我假设标签、刻度注释和轴(甚至围绕点的圆圈)以矢量格式存储,而点几何似乎存储为栅格。恐怕生成的图不可用。所以,我想找到一个选项来强制 ggsave ()
向量化点 geom 而不是打印光栅。我非常希望有人能提供帮助——我迫切需要一种简单的方法来从 R 中导出绘图以供发布,以说服我的实验室更多地依赖 R。
我没有找到使 WMF 设备正常运行的方法,但您可以保存为 SVG,然后使用 R 通过 Inkscape(您需要单独下载的免费软件)自动从 SVG 转换为 EMF,如下所示:
inkscape_path <-'C:/Program Files/Inkscape/inkscape.exe'
if(!file.exists(inkscape_path)) {
warning("Could not find inkscape, will not convert to .emf")
} else {
input_file <- "plot.svg"
output_file <- "plot.emf"
system(paste0('"', inkscape_path,'"', ' --file "', input_file, '" --export-emf "', output_file, '"'))
}
(Inkscape 不支持从命令行导出到 WMF,但为了导入 int Office,WMF 和 EMF 应该可以互换)
编辑: 不幸的是,您无法从命令行访问某些导出设置(特别是 "convert text to paths" 选项)。但是,命令行将使用您上次用于导出 WMF 的设置,因此您可以使用所需设置手动保存一次并自动进行进一步的转换。 (这是一个已知的限制:https://bugs.launchpad.net/inkscape/+bug/1747696)
您可以使用附加 CRAN 包 devEMF 在 R 中直接创建完全矢量化的 EMF(或 EMF+)文件。这避免了导出为 SVG 并随后转换为 EMF 的任何需要。我不确定为什么 ggsave(..., device="wmf")
调用(使用 window API 生成文件)在这里使用光栅绘图符号,但 devEMF 中的函数肯定使用向量(我说这既是 devEMF 的开发者,也是通过放大 LibreOffice 确认的。
安装 devEMF 后,您可以 运行 原始问题中的示例代码,然后:
library(devEMF)
ggsave(filename = "my_file.emf", device = emf)
注意:上面代码中使用的emf
(不带引号)是devEMF定义的一个函数的名称(类似于x11
中使用的原始问题)。 "emf"
(带引号)将被 ggsave 解释为使用 windows API 的请求。你想要前者不带引号,而不是后者带引号。
或者,可以替换对 x11
的原始调用,直接生成 emf 文件,无需 ggsave
:
library (ggplot2)
library (devEMF)
plot_data <- data.frame (a = runif (1:20),
b = seq (1:20))
emf (file = "my_file.emf", width = 3, height = 3)
ggplot (data = plot_data, mapping = aes (x = a, y = b)) +
geom_point () +
labs (x = "my x-label", y = "my y-label") +
theme (panel.background = element_blank(),
panel.border = element_rect (fill = NA, size = 0.7),
axis.ticks = element_line (color = "black", lineend = "round"),
axis.ticks.length = unit (2, "mm"),
axis.text = element_text (color = "black"),
plot.margin = unit(rep (0, 4), "cm")
)
dev.off() #must close device to close file!
根据我的经验,MS Office 对 EMF 和 EMF+ 的支持与 WMF 一样完整,因此生成 EMF 是此用例的合理解决方案。如果您 运行 遇到兼容性问题,请查看 emf
函数的 emfPlus* 参数(参见 help("emf", package="devEMF")
)。