如果文件是在带有 squash 的 rebase 中添加和删除的，git 是否会从索引和历史记录中永久删除文件？
Will git permanently remove files from index and history if the files were added and removed within a rebase with squash?
有人在 develop 分支上添加了一个他们不应该添加到我们的 repo 的目录，我已经删除了这些文件。现在，如果我回去做一个变基并压缩从添加之前到添加之后的提交，是否就像文件从未添加到回购协议中一样，或者它们是否仍然在索引或历史记录中的某个地方？
索引永远不会永久存在。它主要是 临时 数据结构，Git 使用它来构建您所做的 next 提交。您可以随时使用 git add 或 git rm 更改它； git checkout 和类似的命令从提交中填充它。所以这部分问题：
will [files] still be in the index
这不是一个明智的问题。
不过，另一部分更有用：
will [files] still be in ... history somewhere?
Git 中的历史 是 提交；提交 是 历史记录。
任何提交都不能更改，但您可以获得 Git 到 忘记 提交。 Git 通过从分支名称、标签名称和其他此类引用开始查找提交：每个引用都恰好包含一个哈希 ID，属于某个底层 Git 对象——主要是提交对象，偶尔也有标签对象，用于带注释的标签.标记对象持有另一个哈希 ID，通常是提交的哈希 ID；提交对象包含额外的提交哈希 ID，用于标识其前身提交。
因此，"history" 包含一个像 master 这样的名称，其中包含一个哈希 ID：一些大而难看的字母和数字串，但我们就称它为 H :
... <-H <-- master
提交 H 本身包含另一个丑陋的大哈希 ID；我们称它为 G:
... <-G <-H <-- master
提交 G 本身包含另一个丑陋的大哈希 ID。我们称这个为 F:
... <-F <-G <-H <-- master
等等，等等。那是历史！
要在 存储库 中查找历史记录，我们只需从所有终点开始并向后工作：
D--E <-- dev
/
A--B--C
\
F--G--H <-- master
Commit A 是第一个，因此它不会更早地连接到任何东西。提交 A-B-C 在 两个 分支上。提交 E 是 dev 的结尾，提交 H 是 master 的结尾。通过从 E 开始并向后工作，我们访问了五个提交。通过从 H 开始并向后工作，我们访问了六个，其中三个与我们从 dev 访问的相同。所以总共有八个提交：三个共享，两个 dev 独有，三个 master.
独有
git rebase所做的是复制（一些）提交新的和改进的。假设我们将 dev 变基为只有 一个 独特但经过改进的新提交。让我们称之为一次提交 I。我们只是安排 I 的前身——提交 I 中的哈希 ID 让我们 / Git 倒退——成为提交 C:[=55= 的哈希 ID ]
D--E [abandoned]
/
A--B--C--I <-- dev
\
F--G--H <-- master
现在 dev 上总共有四次提交。
提交 D 和 E 仍然存在 。我们不能改变他们！但是我们也无法 找到 它们，因为我们通过从所有 名称 开始并向后工作来找到提交。没有名字将我们引向 E；没有名字将我们带到 D.
Git 保留一些额外的、隐藏的日志条目——在 Git 调用的 reflogs 中——保留一段时间，以防我们的 rebase 出错.虽然存在这些额外的 reflog 条目，但我们可以使用 git reflog dev 或 git reflog HEAD 来查找提交 E 的哈希 ID，也可能直接查找 D 的哈希 ID。因此，reflogs 使提交保持活动状态。
Reflog 条目最终会过期。一旦过期，它们就会被删除。一旦删除，它们就不再保护提交。一旦 所有 保护消失，提交——及其关联的快照——将有资格进行 垃圾收集，或 GC。 reflog 条目到期的默认值为 30 天和 90 天：90 天是 reachable 条目的时间，30 天是 unreachable 条目的时间条目，reachable 的定义基于存储在引用中的当前散列 ID，该引用通过该引用存在。在您的情况下，重新设置 dev 以将所有旧提交折叠为一个新的和改进的替换，旧的被认为无法访问，因此有 30 天的时间。
因为 Git 总是在创建 new 对象，其中一些最终会被引用并保留下来，默认情况下任何未至少存在 14 天的对象都会被保留来自垃圾收集器。垃圾收集器也不会一直 运行：Git 运行s git gc --auto 到 自动 每当看起来像GC 将是有利可图的。
由于 30 天超过 14 天，您的旧提交将在 rebase 后 30 天后的某个时间收集。为了让它更快发生，您可以立即手动使 reflog 过期，并手动 运行 随后 git gc。但大多数情况下你应该让 Git 去做。
有人在 develop 分支上添加了一个他们不应该添加到我们的 repo 的目录，我已经删除了这些文件。现在，如果我回去做一个变基并压缩从添加之前到添加之后的提交，是否就像文件从未添加到回购协议中一样，或者它们是否仍然在索引或历史记录中的某个地方？
索引永远不会永久存在。它主要是 临时 数据结构，Git 使用它来构建您所做的 next 提交。您可以随时使用 git add 或 git rm 更改它； git checkout 和类似的命令从提交中填充它。所以这部分问题：
will [files] still be in the index
这不是一个明智的问题。
不过，另一部分更有用：
will [files] still be in ... history somewhere?
Git 中的历史 是 提交；提交 是 历史记录。
任何提交都不能更改，但您可以获得 Git 到 忘记 提交。 Git 通过从分支名称、标签名称和其他此类引用开始查找提交：每个引用都恰好包含一个哈希 ID，属于某个底层 Git 对象——主要是提交对象，偶尔也有标签对象，用于带注释的标签.标记对象持有另一个哈希 ID，通常是提交的哈希 ID；提交对象包含额外的提交哈希 ID，用于标识其前身提交。
因此，"history" 包含一个像 master 这样的名称，其中包含一个哈希 ID：一些大而难看的字母和数字串，但我们就称它为 H :
... <-H <-- master
提交 H 本身包含另一个丑陋的大哈希 ID；我们称它为 G:
... <-G <-H <-- master
提交 G 本身包含另一个丑陋的大哈希 ID。我们称这个为 F:
... <-F <-G <-H <-- master
等等，等等。那是历史！
要在 存储库 中查找历史记录，我们只需从所有终点开始并向后工作：
D--E <-- dev
/
A--B--C
\
F--G--H <-- master
Commit A 是第一个，因此它不会更早地连接到任何东西。提交 A-B-C 在 两个 分支上。提交 E 是 dev 的结尾，提交 H 是 master 的结尾。通过从 E 开始并向后工作，我们访问了五个提交。通过从 H 开始并向后工作，我们访问了六个，其中三个与我们从 dev 访问的相同。所以总共有八个提交：三个共享，两个 dev 独有，三个 master.
git rebase所做的是复制（一些）提交新的和改进的。假设我们将 dev 变基为只有 一个 独特但经过改进的新提交。让我们称之为一次提交 I。我们只是安排 I 的前身——提交 I 中的哈希 ID 让我们 / Git 倒退——成为提交 C:[=55= 的哈希 ID ]
D--E [abandoned]
/
A--B--C--I <-- dev
\
F--G--H <-- master
现在 dev 上总共有四次提交。
提交 D 和 E 仍然存在 。我们不能改变他们！但是我们也无法 找到 它们，因为我们通过从所有 名称 开始并向后工作来找到提交。没有名字将我们引向 E；没有名字将我们带到 D.
Git 保留一些额外的、隐藏的日志条目——在 Git 调用的 reflogs 中——保留一段时间，以防我们的 rebase 出错.虽然存在这些额外的 reflog 条目，但我们可以使用 git reflog dev 或 git reflog HEAD 来查找提交 E 的哈希 ID，也可能直接查找 D 的哈希 ID。因此，reflogs 使提交保持活动状态。
Reflog 条目最终会过期。一旦过期，它们就会被删除。一旦删除，它们就不再保护提交。一旦 所有 保护消失，提交——及其关联的快照——将有资格进行 垃圾收集，或 GC。 reflog 条目到期的默认值为 30 天和 90 天：90 天是 reachable 条目的时间，30 天是 unreachable 条目的时间条目，reachable 的定义基于存储在引用中的当前散列 ID，该引用通过该引用存在。在您的情况下，重新设置 dev 以将所有旧提交折叠为一个新的和改进的替换，旧的被认为无法访问，因此有 30 天的时间。
因为 Git 总是在创建 new 对象，其中一些最终会被引用并保留下来，默认情况下任何未至少存在 14 天的对象都会被保留来自垃圾收集器。垃圾收集器也不会一直 运行：Git 运行s git gc --auto 到 自动 每当看起来像GC 将是有利可图的。
由于 30 天超过 14 天，您的旧提交将在 rebase 后 30 天后的某个时间收集。为了让它更快发生，您可以立即手动使 reflog 过期，并手动 运行 随后 git gc。但大多数情况下你应该让 Git 去做。