如何根据 Bash 的数字列表删除文件中的一系列位置
How to delete a series of positions within a file based on a list of numbers with Bash
我是 Bash 脚本编写的新手，我有一个问题需要解决。我有一个看起来像这样的文件：
>atac
ATTGGCAATTAAATTCTTTT
>lipa
ATTACCAAGTAAATTCTTTT
.
.
.
其中每个偶数行的长度相同，但可以有不同的字符，我需要在每个偶数行中删除 .txt 文件中列出的一系列位置。 .txt 只有一个数字列表，每行一个，对应于要删除的位置，如下所示：
3
5
8
10
11
预期的输出必须保持每一偶数行的长度相同，但在每一行中，.txt 文件中列出的位置必须已被删除。
有什么建议吗？
如果 txt 文件中的 "position" 始终表示原始字符串的索引，这个 awk-oneliner 将帮助您：
awk 'NR==FNR{a[[=10=]];next}FNR%2==0{for(x in a)$x=""}7' your.txt FS="" OFS="" file
>atac
ATGCATAATTCTTTT
>lipa
ATACAGAATTCTTTT
我们标记（如“-”）删除的字符，以便您验证结果是否正确：
awk 'NR==FNR{a[[=11=]];next}FNR%2==0{for(x in a)$x="-"}7' txt FS="" OFS="" file
>atac
AT-G-CA-T--AATTCTTTT
>lipa
AT-A-CA-G--AATTCTTTT
我是 Bash 脚本编写的新手，我有一个问题需要解决。我有一个看起来像这样的文件：
>atac
ATTGGCAATTAAATTCTTTT
>lipa
ATTACCAAGTAAATTCTTTT
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其中每个偶数行的长度相同，但可以有不同的字符，我需要在每个偶数行中删除 .txt 文件中列出的一系列位置。 .txt 只有一个数字列表，每行一个，对应于要删除的位置，如下所示：
3
5
8
10
11
预期的输出必须保持每一偶数行的长度相同，但在每一行中，.txt 文件中列出的位置必须已被删除。 有什么建议吗？
如果 txt 文件中的 "position" 始终表示原始字符串的索引，这个 awk-oneliner 将帮助您：
awk 'NR==FNR{a[[=10=]];next}FNR%2==0{for(x in a)$x=""}7' your.txt FS="" OFS="" file
>atac
ATGCATAATTCTTTT
>lipa
ATACAGAATTCTTTT
我们标记（如“-”）删除的字符，以便您验证结果是否正确：
awk 'NR==FNR{a[[=11=]];next}FNR%2==0{for(x in a)$x="-"}7' txt FS="" OFS="" file
>atac
AT-G-CA-T--AATTCTTTT
>lipa
AT-A-CA-G--AATTCTTTT