R Docker: 无法通过套接字连接到本地 MySQL 服务器

Question

我使用了一个 golem 管道来打包和 docker我的应用程序。

对于初学者，我正在尝试使用 docker 在 windows 电脑上本地部署应用程序（也尝试在 linux 上运行它遇到同样的问题） .该应用程序也在我的电脑上运行收集来自本地 SQlite 数据库的数据（一旦部署在服务器上就会类似）。

当我运行将应用程序打包时，应用程序运行正常。但是一旦我创建了一个 docker 图像并运行它，该应用程序启动但无法连接到我的本地 sql 数据库，返回此错误： 无法通过套接字 '/var/run/mysqld/mysqld.sock' (2 "No such file or directory")

连接到本地 MySQL 服务器

与应用内数据库的连接如下所示：

    con =  dbConnect(RMariaDB::MariaDB(), dbname = "training_dash_db", user = "root", password = "", host = '127.0.0.1')

我的 docker 文件如下所示：

FROM rocker/tidyverse:3.5.3
RUN R -e 'install.packages("remotes")'
RUN R -e 'remotes::install_github("r-lib/remotes", ref = "97bbf81")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("shiny")'
RUN R -e 'remotes::install_github("Thinkr-open/golem")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("processx")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("attempt")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("DT")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("glue")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("htmltools")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("shinydashboard")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("shinydashboardPlus")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("lubridate")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("dplyr")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("purrr")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("plotly")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("DBI")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("tibbletime")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("tsibble")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("shinyWidgets")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("leaflet")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("pool")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("RMariaDB")'
RUN R -e 'remotes::install_cran("roxygen2")'
COPY K2dashboard_*.tar.gz /app.tar.gz
RUN R -e 'remotes::install_local("/app.tar.gz")'
EXPOSE 80
EXPOSE 3306
CMD R -e "options('shiny.port'=80,shiny.host='0.0.0.0');K2dashboard::run_app()"

谢谢。

Answer 1

以下是我能看到的问题：

您正在使用 127.0.0.1 作为数据库的主机。一旦进入容器，这个地址指的是容器的内部IP，而不是来自你的主机/另一个容器的IP。因此您的应用无法访问主机数据库。
您还没有在您的容器中安装 MariaDB 的驱动程序

解决方案如下：

您可以使用 r-db docker 图片作为来源：http://colinfay.me/r-db/, which contains drivers for MariaDB: http://colinfay.me/r-db/mariadb-rmariadb.html
取决于你的 MYSQL 是否在 docker 中，但你可以创建一个 Docker 网络，并插入你的 mysql这个网络上的容器和你的 golem 容器。然后使用host = "my-network"。有关信息，请参阅 r-db 文档：http://colinfay.me/r-db/intro.html#creating-docker-network, and http://colinfay.me/r-db/mariadb-rmariadb.html for the mariadb part
您想从容器内部访问计算机上的数据库：请参阅了解相关信息。

R Docker: 无法通过套接字连接到本地 MySQL 服务器

R Docker: Can't connect to local MySQL server through socket

mysql

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shiny

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golem