在 r 中向量的边界处填充 NA

Question

我有一个在边界处包含 NA 的向量

x <- c(NA, -1, 1,-1, 1, NA, -1, 2, NA, NA)

我希望结果是：

c(-3, -1, 1,-1, 1, 0, -1, 2, 5, 8)

换句话说，我想用线性插值填充内部和边界 NA（也许我不能称它为“inter-polation”，因为 NA 在边界处）。

我尝试了Package "zoo", na.fill(x, "extend")中的函数，但是边界输出不是我想要的，它只是重复了最左边或最右边非 NA 值：

na.fill(x,"extend")

输出为

[1] -1 -1  1 -1  1  0 -1  2  2  2

我还检查了其他用于填充 NA 的函数，例如 na.approx()、na.locf() 等，但其中 none 有效。

na.spline 确实有效，但边界 NA 的输出会导致极大的变化。

na.spline(x)

输出为：

 [1] -15.9475983  -1.0000000   1.0000000  -1.0000000   1.0000000   0.3400655  -1.0000000   2.0000000
 [9]  13.1441048  35.9323144

边界点太大。谁能帮我吗？提前致谢！

Answer 1

您可以使用 zoo 库中的 na.spline()：

na.spline(x)

[1] 0.0 0.5 1.0 1.5 2.0 2.5

原题数据：

x <- c(0, NA, 1, NA, 2, NA)

Answer 2

根据问题编辑后的数据和预期输出，我相信以下函数可以做到。它用approxfun填充内部NA，然后一一处理极端。

na.extrapol <- function(y){
  x <- seq_along(y)
  f <- approxfun(x[!is.na(y)], y[!is.na(y)])
  y[is.na(y)] <- f(x[is.na(y)])
  r <- rle(is.na(y))
  if(r$values[1]){
    Y <- y[r$lengths[1] + 1:2]
    X <- seq_len(r$lengths[1])
    y[rev(X)] <- Y[1] - diff(Y)*X
  }
  n <- length(r$lengths)
  if(r$values[n]){
    s <- sum(r$lengths[-n])
    Y <- y[s - 1:0]
    X <- seq_len(r$lengths[n])
    y[s + X] <- Y[2] + diff(Y)*X
  }
  y
}

x <- c(NA, -1, 1,-1, 1, NA, -1, 2, NA, NA)
na.extrapol(x)
#[1] -3 -1  1 -1  1  0 -1  2  5  8

x2 <- c(NA, NA, -1, 1,-1, 1, NA, -1, 2, NA, NA)
na.extrapol(x2)
#[1] -5 -3 -1  1 -1  1  0 -1  2  5  8

Answer 3

这是一种方法：

首先，我们进行线性近似，这将使我们从左到右留下所有 tail NA-s:

x <- na.approx(x, method = "constant", f = 0.5,na.rm = F)

现在让我们找到非 NA 向量和关联的最左边和最右边的算术级数增量项：

x_c <- x[!is.na(x)]
left <- x_c[1] - x_c[2]
right <- x_c[length(x_c)] - x_c[length(x_c) - 1]

现在是时候用等差数列得到的数来填充左右NA-s：

ind_x<- which(!is.na(x))
big_M <- 100

x[(ind_x[length(ind_x)]):length(x)] <- seq(x[ind_x[length(ind_x)]],
                                           sign(right) * big_M,
                                           right)[1:(length(x) - ind_x[length(ind_x)] + 1)]
x[ind_x[1]:1] <- seq(x[ind_x[1]],sign(left) * big_M,left)[1:ind_x[1]]
y <- x

其中 big_M 是用户定义的大数，在给定基础数据的情况下，算术级数不会超过该数。

输入-输出：

x <- c(NA, -1, 1,-1, 1, NA, -1, 2, NA, NA)
> y
 [1] -3 -1  1 -1  1  0 -1  2  5  8

x <- c(NA,NA,NA, -1, 1,-1, 1, NA, -1, 2, NA, NA,NA)
> y
 [1] -7 -5 -3 -1  1 -1  1  0 -1  2  5  8 11

x <- c(NA,NA,NA, 5,1, 1,-1, 1, NA, -1, 2, NA, NA,NA)
> y
 [1] 17 13  9  5  1  1 -1  1  0 -1  2  5  8 11

Answer 4

除了考虑 Hmisc::approxExtrap 之外，另一个选择是使用 lm 但它很可能比这里的其他选项慢

x <- c(NA, -1, 1,-1, 1, NA, -1, 2, NA, NA)
DF <- data.frame(i=seq_along(x), x)
cc <- DF[complete.cases(DF),]
DF$x <- approx(cc$i, cc$x, DF$i)$y
hh <- head(cc, 2L)
tt <- tail(cc, 2L)
DF$x[DF$i < hh$i[1L]] <- predict(lm(x ~ i, hh), DF[DF$i < hh$i[1L], "i", drop=FALSE])
DF$x[DF$i > tt$i[2L]] <- predict(lm(x ~ i, tt), DF[DF$i > tt$i[2L], "i", drop=FALSE])
DF

输出：

在 r 中向量的边界处填充 NA

Fill NA's at boundary of a vector in r

r

linear-interpolation

zoo

na