如何将天珠文件转换为多层金字塔 tiff 格式
how to convert dzi files to multi-tile pyramidal tiff format
参考答案()
本人对这个话题一窍不通,如有不妥请指正
我正在尝试从 .dzi(深度缩放图像)格式创建多平铺 tiff,我的做法是:
(i) 选择最大级别的文件夹。
(ii) 将m行的n列全部垂直拼接(m_n.jpeg,我指的是这种格式保存的图片)为png图片。所以他们占据了相当多的space.
(iii) 最后,我使用 pyvips.Image.write_to_file().
将所有这些垂直 png 图像水平合并为单个完整图像 png
(iv) 最后使用 vips im_save,我将完整图像 png 转换为 tiff。
我现在担心的是,这个过程花费了将近 2 个小时来制作 30,000 base_tiles 的完整图像 png,而且它占 10+ GB 的大小(完整图像 png)。
有没有更好更快的方法将 .dzi 转换为 tiff?
libvips has an arrayjoin
运算符,可以将一组图块连接成一个大图像。
你可以这样使用它(在linux命令行):
vips arrayjoin "$(ls *.jpeg | sort -t_ -k2g -k1g)" x.tif[tile,pyramid,compression=jpeg] --across 20
这将加载当前目录中的所有 JPG 图像,assemble 将它们放入一个巨大的网格中,横跨 20 个图像,并写为 TIFF 金字塔。显然,您需要检查网格的大小,并调整 across
参数。
$()
部分首先按 y,然后按数字顺序对 x_y.jpg
形式的文件名进行排序。否则,瓷砖将被调换,令人讨厌。
假设重叠为 0。如果您的图块有重叠,您需要设置 hspacing
和 vspacing
选项来控制图块的定位方式。例如:
vips arrayjoin "$(ls *.jpg | sort -t_ -k2g -k1g)" x.tif --across 20 --hspacing 254 --vspacing 254
将在水平和垂直方向上每 254 个像素定位一次图块。
arrayjoin
必须能够打开所有输入图像,因此需要大量文件描述符。大多数 linuxes 默认为每个进程一次最多打开 1024 个文件,因此您可能需要提高该数字。通常你只需编辑几个配置文件,然后注销并重新登录。我将我的系统设置为 65536,但你可以使用任何数字。
Windows 每个进程有 2000 个文件的硬性限制,您无法更改。您需要 assemble 在该平台上的部分。
这是一个有效的例子。首先,创建一个没有重叠的 deepzoom 金字塔:
john@kiwi:~/pics/x$ vips dzsave ~/pics/k2.jpg x --overlap 0
john@kiwi:~/pics/x$ cd x_files/11
john@kiwi:~/pics/x/x_files/11$ ls
0_0.jpeg 0_7.jpeg 1_5.jpeg 2_3.jpeg 3_1.jpeg 3_8.jpeg 4_6.jpeg 5_4.jpeg
0_1.jpeg 0_8.jpeg 1_6.jpeg 2_4.jpeg 3_2.jpeg 4_0.jpeg 4_7.jpeg 5_5.jpeg
0_2.jpeg 1_0.jpeg 1_7.jpeg 2_5.jpeg 3_3.jpeg 4_1.jpeg 4_8.jpeg 5_6.jpeg
0_3.jpeg 1_1.jpeg 1_8.jpeg 2_6.jpeg 3_4.jpeg 4_2.jpeg 5_0.jpeg 5_7.jpeg
0_4.jpeg 1_2.jpeg 2_0.jpeg 2_7.jpeg 3_5.jpeg 4_3.jpeg 5_1.jpeg 5_8.jpeg
0_5.jpeg 1_3.jpeg 2_1.jpeg 2_8.jpeg 3_6.jpeg 4_4.jpeg 5_2.jpeg
0_6.jpeg 1_4.jpeg 2_2.jpeg 3_0.jpeg 3_7.jpeg 4_5.jpeg 5_3.jpeg
你可以看到它是由 6 横 9 横的瓷砖组成的网格。
现在重新assemble 瓷砖并写成 TIFF 金字塔:
john@kiwi:~/pics/x/x_files/11$ vips arrayjoin "$(ls *.jpeg | sort -t_ -k2g -k1g)" x.tif[tile,pyramid,compression=jpeg] --across 6
john@kiwi:~/pics/x/x_files/11$ vipsheader x.tif
x.tif: 1524x2286 uchar, 3 bands, srgb, tiffload_stream
使用 pyvips 会是这样的:
#!/usr/bin/env python3
import pyvips
tiles_across = 142
tiles_down = 150
tiles = [pyvips.Image.new_from_file(f"{x}_{y}.jpeg", access="sequential")
for y in range(tiles_down) for x in range(tiles_across)]
im = pyvips.Image.arrayjoin(tiles, across=tiles_across)
im.write_to_file("x.jpg")
在这台笔记本电脑上加入 21,000 个图块需要大约 10 分钟和 6gb 的内存。
参考答案(
本人对这个话题一窍不通,如有不妥请指正
我正在尝试从 .dzi(深度缩放图像)格式创建多平铺 tiff,我的做法是:
(i) 选择最大级别的文件夹。
(ii) 将m行的n列全部垂直拼接(m_n.jpeg,我指的是这种格式保存的图片)为png图片。所以他们占据了相当多的space.
(iii) 最后,我使用 pyvips.Image.write_to_file().
将所有这些垂直 png 图像水平合并为单个完整图像 png(iv) 最后使用 vips im_save,我将完整图像 png 转换为 tiff。
我现在担心的是,这个过程花费了将近 2 个小时来制作 30,000 base_tiles 的完整图像 png,而且它占 10+ GB 的大小(完整图像 png)。
有没有更好更快的方法将 .dzi 转换为 tiff?
libvips has an arrayjoin
运算符,可以将一组图块连接成一个大图像。
你可以这样使用它(在linux命令行):
vips arrayjoin "$(ls *.jpeg | sort -t_ -k2g -k1g)" x.tif[tile,pyramid,compression=jpeg] --across 20
这将加载当前目录中的所有 JPG 图像,assemble 将它们放入一个巨大的网格中,横跨 20 个图像,并写为 TIFF 金字塔。显然,您需要检查网格的大小,并调整 across
参数。
$()
部分首先按 y,然后按数字顺序对 x_y.jpg
形式的文件名进行排序。否则,瓷砖将被调换,令人讨厌。
假设重叠为 0。如果您的图块有重叠,您需要设置 hspacing
和 vspacing
选项来控制图块的定位方式。例如:
vips arrayjoin "$(ls *.jpg | sort -t_ -k2g -k1g)" x.tif --across 20 --hspacing 254 --vspacing 254
将在水平和垂直方向上每 254 个像素定位一次图块。
arrayjoin
必须能够打开所有输入图像,因此需要大量文件描述符。大多数 linuxes 默认为每个进程一次最多打开 1024 个文件,因此您可能需要提高该数字。通常你只需编辑几个配置文件,然后注销并重新登录。我将我的系统设置为 65536,但你可以使用任何数字。
Windows 每个进程有 2000 个文件的硬性限制,您无法更改。您需要 assemble 在该平台上的部分。
这是一个有效的例子。首先,创建一个没有重叠的 deepzoom 金字塔:
john@kiwi:~/pics/x$ vips dzsave ~/pics/k2.jpg x --overlap 0
john@kiwi:~/pics/x$ cd x_files/11
john@kiwi:~/pics/x/x_files/11$ ls
0_0.jpeg 0_7.jpeg 1_5.jpeg 2_3.jpeg 3_1.jpeg 3_8.jpeg 4_6.jpeg 5_4.jpeg
0_1.jpeg 0_8.jpeg 1_6.jpeg 2_4.jpeg 3_2.jpeg 4_0.jpeg 4_7.jpeg 5_5.jpeg
0_2.jpeg 1_0.jpeg 1_7.jpeg 2_5.jpeg 3_3.jpeg 4_1.jpeg 4_8.jpeg 5_6.jpeg
0_3.jpeg 1_1.jpeg 1_8.jpeg 2_6.jpeg 3_4.jpeg 4_2.jpeg 5_0.jpeg 5_7.jpeg
0_4.jpeg 1_2.jpeg 2_0.jpeg 2_7.jpeg 3_5.jpeg 4_3.jpeg 5_1.jpeg 5_8.jpeg
0_5.jpeg 1_3.jpeg 2_1.jpeg 2_8.jpeg 3_6.jpeg 4_4.jpeg 5_2.jpeg
0_6.jpeg 1_4.jpeg 2_2.jpeg 3_0.jpeg 3_7.jpeg 4_5.jpeg 5_3.jpeg
你可以看到它是由 6 横 9 横的瓷砖组成的网格。
现在重新assemble 瓷砖并写成 TIFF 金字塔:
john@kiwi:~/pics/x/x_files/11$ vips arrayjoin "$(ls *.jpeg | sort -t_ -k2g -k1g)" x.tif[tile,pyramid,compression=jpeg] --across 6
john@kiwi:~/pics/x/x_files/11$ vipsheader x.tif
x.tif: 1524x2286 uchar, 3 bands, srgb, tiffload_stream
使用 pyvips 会是这样的:
#!/usr/bin/env python3
import pyvips
tiles_across = 142
tiles_down = 150
tiles = [pyvips.Image.new_from_file(f"{x}_{y}.jpeg", access="sequential")
for y in range(tiles_down) for x in range(tiles_across)]
im = pyvips.Image.arrayjoin(tiles, across=tiles_across)
im.write_to_file("x.jpg")
在这台笔记本电脑上加入 21,000 个图块需要大约 10 分钟和 6gb 的内存。