ggraph：根据属性的顶点位置

Question

假设我有一个如下所示的 igraph 图表：

library(ggraph)
library(igraph)

vertices <- data.frame(name = LETTERS[1:6],
                       time = c(0, 9, 9, 10, 10, 10))
edges <- data.frame(from = c("A", "B", "B", "A", "C", "C"),
                    to =   c("B", "D", "E", "C", "E", "F"))
graph <- graph_from_data_frame(edges, 
                               directed = TRUE, 
                               vertices = vertices)

为了目前的目的，图表将始终是树或 DAG，我想使用 ggraph 以树状布局绘制图表。我的问题是：How to plot this graph with the time vertex attribute for y-values?

我可以在 geom_node_point 中设置 aes(y = time) 以正确定位节点，但边缘不跟随：

ggraph(graph, layout = "tree") + 
  geom_node_point(aes(y = time)) +
  geom_edge_link() +
  theme_bw()

^{由 reprex package (v0.3.0)}

于 2019-11-17 创建

在 geom_edge_link 中将 y 或 yend 美学设置为 time 会引发错误。

我是 ggraph 的新手，所以我不知道如何处理这个问题。

Answer 1

它并不漂亮，但您可以通过创建自己的布局来实现。

LO = layout_as_tree(graph)
LO[, 2] = V(graph)$time

ggraph(graph, layout = LO) + 
  geom_node_point() +
  geom_edge_link() +
  theme_bw()

ggraph：根据属性的顶点位置

ggraph: Vertex position according to attribute

r

igraph

ggraph