是否有使用 MuMin 的疏浚功能解决 glmmTMB 模型中的非收敛问题的解决方法？

Question

我已经尝试使用 MuMin-Package 的 dredge-function 来构建负二项式广义线性混合模型，该模型装有 glmmTMB 包。

因为我的完整模型无法收敛，我已经尝试了此处描述的解决方法：

但是当我使用简化模型并重写 model$call$function 中的函数时，dredge 会忽略此更改并使用简化模型而不是完整模型。

对于 glmmTMB 包的功能是否有其他解决方法？

下面是一些示例代码：

# The full_model does not converge
full_model <- glmmTMB(y ~ x1 * x2 * (x3 + x4 + x5 + x6) + (1|RE1/RE1.1/RE1.2) + (1|RE2), data = df, family = "nbinom2")

# The simple_model does converge
simple_model <- glmmTMB(y ~ x1 + x2 + x3 + x4 + x5 + x6 + (1|RE1/RE1.1/RE1.2) + (1|RE2), data = df, family = "nbinom2")

# Change formula in the model
simple_model$call$formula <- y ~ x1 * x2 * (x3 + x4 + x5 + x6) + (1|RE1/RE1.1/RE1.2) + (1|RE2)

# use dredge, but this ignores the changed formula
dredge(simple_model)

谢谢！

Answer 1

您必须替换 simple_model $ modelInfo $ allForm 的元素。这是三个公式："formula"、"ziformula" 和 "dispformula"，但对于您的模型，只使用第一个。

是否有使用 MuMin 的疏浚功能解决 glmmTMB 模型中的非收敛问题的解决方法？

Is there a workaround for non-convergence in glmmTMB models using the dredge function of MuMin?

r

mumin