使用栅格写入压缩的 netCDF4 文件
Writing compressed netCDF4 files with raster
我想使用 raster
包编写压缩的 netCDF4 文件。
ncdf4
和 rgdal
安装正确。
然而,以下内容无法 return netCDF4 压缩文件:
library(raster)
r <- raster() <- runif(86400)
r[] <- <- runif(86400)
writeRaster(r, "test.nc", options=c("COMPRESS=DEFLATE", "FORMAT=NC4"))
事实上它只是 return 一个标准的 netCDF 文件:
bash $ > cdo sinfo test.nc
File format : netCDF
不仅未压缩,甚至连 netCDF4 也没有。
根据 GDAL 文档,这些选项应该有效(请参阅 here,在 "Creation options" 下)。
根据光栅手册,在writeRaster
:
下
options: Character. File format specific GDAL options. E.g., when
writing a geotiff file you can use: options=c("COMPRESS=NONE",
"TFW=YES")
有什么问题吗?
ncdf 文件不是通过 GDAL 写入的,因为 rgdal 包(至少 windows 上的二进制版本)没有随 ncdf 驱动程序一起提供。相反,writeRaster 使用包 ncdf
或(最好)ncdf4
,因此您必须使用 ncdf4 包(在 ncvar_def
函数中)提供的参数。也就是说,您可以执行 compression=7
等操作,这会自动将文件转换为 ncdf4 格式。但是,raster
的当前版本会忽略这些参数。我已在 R-Forge 的开发版本(版本 2.4-7)中修复了该问题,这样您就可以:
writeRaster(r, "test.nc", datatype='INT2S', force_v4=TRUE, compression=7)
(force_v4
参数传递给 nc_create
)。
我想使用 raster
包编写压缩的 netCDF4 文件。
ncdf4
和 rgdal
安装正确。
然而,以下内容无法 return netCDF4 压缩文件:
library(raster)
r <- raster() <- runif(86400)
r[] <- <- runif(86400)
writeRaster(r, "test.nc", options=c("COMPRESS=DEFLATE", "FORMAT=NC4"))
事实上它只是 return 一个标准的 netCDF 文件:
bash $ > cdo sinfo test.nc
File format : netCDF
不仅未压缩,甚至连 netCDF4 也没有。
根据 GDAL 文档,这些选项应该有效(请参阅 here,在 "Creation options" 下)。
根据光栅手册,在writeRaster
:
options: Character. File format specific GDAL options. E.g., when writing a geotiff file you can use: options=c("COMPRESS=NONE", "TFW=YES")
有什么问题吗?
ncdf 文件不是通过 GDAL 写入的,因为 rgdal 包(至少 windows 上的二进制版本)没有随 ncdf 驱动程序一起提供。相反,writeRaster 使用包 ncdf
或(最好)ncdf4
,因此您必须使用 ncdf4 包(在 ncvar_def
函数中)提供的参数。也就是说,您可以执行 compression=7
等操作,这会自动将文件转换为 ncdf4 格式。但是,raster
的当前版本会忽略这些参数。我已在 R-Forge 的开发版本(版本 2.4-7)中修复了该问题,这样您就可以:
writeRaster(r, "test.nc", datatype='INT2S', force_v4=TRUE, compression=7)
(force_v4
参数传递给 nc_create
)。