data.table高效回收V2

data.table efficient recycling V2

这是这个问题的后续:

这里的区别是每行的未来年数不一定相同..

我经常在 data.table 中使用回收,例如,当我需要对未来几年进行预测时。我会在未来的每一年重复我的原始数据。

这可能会导致类似的结果:

library(data.table)
dt <- data.table(1:500000, 500000:1, rpois(500000, 240))
dt2 <- dt[, c(.SD, .(year = 1:V3)), by = 1:nrow(dt) ]

但我经常需要处理数百万行和比这个玩具示例中更多的列。时间增加..试试这个:

library(data.table)
dt <- data.table(1:5000000, 5000000:1, rpois(5000000, 240))
dt2 <- dt[, c(.SD, .(year = 1:V3)), by = 1:nrow(dt) ]

我的问题是:有没有更有效的方法来实现这个目的?

感谢您的帮助!

这是一个更快的实现,但由于 data.table

中的 lapply 循环仍然很长
dt2 <- data.table(
  rep(dt$V1, dt$V3),
  rep(dt$V2, dt$V3),
  rep(dt$V3, dt$V3),
  unlist(lapply(dt$V3, function(x){1:x}))
)

希望对您有所帮助!

这是另一个答案的略微改进版本。

  • 使用非默认值 unlist
  • rep.int 而不是 rep
  • seq_len 而不是 :
  • setDT 而不是 data.table()
  • @Cole
  • 建议的 sequence 函数更好
  • 以及内部 vecseq
  • 的进一步小改进

放在一起似乎有所不同。

时间...

library(data.table)
f0 = function(dt) {
  dt[, c(.SD, .(year = 1:V3)), by = 1:nrow(dt) ]
}
f1 = function(dt) {
  dt2 <- data.table(
    rep(dt$V1, dt$V3),
    rep(dt$V2, dt$V3),
    rep(dt$V3, dt$V3),
    unlist(lapply(dt$V3, function(x){1:x}))
  )
  dt2
}
f2 = function(dt) {
  dt2 = list(
    V1 = rep.int(dt$V1, dt$V3),
    V2 = rep.int(dt$V2, dt$V3),
    V3 = rep.int(dt$V3, dt$V3),
    year = unlist(lapply(dt$V3, seq_len), recursive=FALSE, use.names=FALSE)
  )
  setDT(dt2)
  dt2
}
f3 = function(dt) {
  ## even better with sequence function suggested by @Cole
  dt2 = list(
    V1 = rep.int(dt$V1, dt$V3),
    V2 = rep.int(dt$V2, dt$V3),
    V3 = rep.int(dt$V3, dt$V3),
    year = sequence(dt$V3)
  )
  setDT(dt2)
  dt2
}
f4 = function(dt) {
  dt[, c(lapply(.SD, rep.int, V3), year = .(sequence(V3)))]
}
f5 = function(dt) {
  dt2 = list(
    V1 = rep.int(dt$V1, dt$V3),
    V2 = rep.int(dt$V2, dt$V3),
    V3 = rep.int(dt$V3, dt$V3),
    year = data.table:::vecseq(rep.int(1L,length(dt$V3)), dt$V3, NULL)
  )
  setDT(dt2)
  dt2
}

关于“大”数据

dt <- data.table(1:5000000, 5000000:1, rpois(5000000, 240))
system.time(f0(dt))
#   user  system elapsed 
# 22.100  18.914  40.449 
system.time(f1(dt))
#   user  system elapsed 
# 35.866  15.607  51.475 
system.time(f2(dt))
#   user  system elapsed 
# 22.922   6.839  29.760 
system.time(f3(dt))
#   user  system elapsed 
#  6.509   6.723  13.233 
system.time(f4(dt))
#   user  system elapsed 
# 12.140  14.114  26.254 
system.time(f5(dt))
#   user  system elapsed 
#  6.448   4.057  10.506 

无论如何,您应该尝试改进您在扩展数据集上 运行 的流程,因为也许您一开始就不必扩展它。

例如,在 frollmean 函数中有一个参数 adaptive,它可以计算可变长度 window 上的滚动平均值,通常计算该值需要先扩充数据。 V3 在您的数据中提醒了很多 window 自适应移动平均线的长度。

试试这个:

  dt2 <- dt[dt[,rep(1:nrow(dt),V3)],]
  dt2[,year:= dt[,sequence(V3)]]