org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser 警告警告：行：901 预期白色 space 位置：6 行：</rdf:RDF>

Question

我正在使用 java 项目从文件 (dbpedia_2016-10.owl) 加载 ontology，向此 ontology 添加一些公理，然后写入 .owl 文件作为新文件 ontology。稍后在我的项目中，我使用 OWLOntology 中的 loadOntologyFromOntologyDocument(new File("DBpedia_modified.owl")) 加载新的 ontology 并且我在多行中收到此警告：我注意到解析器在 pos 5 时不满意或 pos 6，对应字符 ::

Jan 04, 2020 12:57:49 PM org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser warn
WARNING: LINE: 84  Expected white space at pos: 5  LINE:
<owl:someValuesFrom rdf:resource="http://dbpedia.org/ontology/MusicGenre"/>
Jan 04, 2020 12:57:49 PM org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser warn
WARNING: LINE: 85  Expected white space at pos: 6  LINE:
</owl:Restriction>

因为我是这个领域的新手，所以我不明白为什么解析器期望 white space 而不是 :；我的问题是警告有多严重？我该如何解决？我用谷歌搜索，但没有找到合适的回复。

提前感谢您的指导。

Answer 1

您可以忽略此警告。您的文件是 RDF 格式，警告来自 OBO 解析器。

如果您没有指定 ontology 使用哪种格式，OWLAPI 将尝试所有可用的解析器，直到找到一个接受 ontology 的解析器。 OBO 解析器拒绝解析 ontology（正确），并且它还发出警告，这超出了它应该做的，因为此时它应该已经抛出异常。

编辑：为避免使用 OBO 解析器，您可以select应该使用的格式：

manager.loadOntologyFromOntologyDocument(
        new FileDocumentSource(file, new RDFXMLDocumentFormat()));

这将只尝试一个解析器（我猜你的文件格式是 RDF/XML）。

org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser 警告警告：行：901 预期白色 space 位置：6 行：</rdf:RDF>

org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser warn WARNING: LINE: 901 Expected white space at pos: 6 LINE: </rdf:RDF>

java

parsing

ontology

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