以管道作为估计器的投票分类器

Question

我想用多个不同的模型（决策树、SVC 和 Keras 网络）构建一个 sklearn VotingClassifier 集成。他们都需要不同类型的数据预处理，这就是为什么我为他们每个人制作了一个管道。

# Define pipelines

# DTC pipeline
featuriser = Featuriser()
dtc = DecisionTreeClassifier()
dtc_pipe = Pipeline([('featuriser',featuriser),('dtc',dtc)])

# SVC pipeline
scaler = TimeSeriesScalerMeanVariance(kind='constant')
flattener = Flattener()
svc = SVC(C = 100, gamma = 0.001, kernel='rbf')
svc_pipe = Pipeline([('scaler', scaler),('flattener', flattener), ('svc', svc)])

# Keras pipeline
cnn = KerasClassifier(build_fn=get_model())
cnn_pipe = Pipeline([('scaler',scaler),('cnn',cnn)])

# Make an ensemble
ensemble = VotingClassifier(estimators=[('dtc', dtc_pipe), 
                                        ('svc', svc_pipe),
                                        ('cnn', cnn_pipe)], 
                            voting='hard')

Featuriser、TimeSeriesScalerMeanVariance 和 Flattener 类是一些定制的变压器，它们都使用 fit、transform 和 fit_transform 方法。

当我尝试 ensemble.fit(X, y) 适合整个整体时，我收到错误消息：

ValueError: The estimator list should be a classifier.

我能理解，因为各个估计器不是专门的分类器，而是管道。有没有办法让它继续工作？

Answer 1

问题出在 KerasClassifier。它不提供在 _validate_estimator.

中检查过的 _estimator_type

不是使用pipeline的问题。管道以属性形式提供此信息。参见 here。

因此，快速修复是设置 _estimator_type='classifier'。

一个可重现的例子：

# Define pipelines
from sklearn.pipeline import Pipeline
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.svm import SVC
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler, Normalizer
from sklearn.ensemble import VotingClassifier
from keras.wrappers.scikit_learn import KerasClassifier
from sklearn.datasets import make_classification
from keras.layers import Dense
from keras.models import Sequential

X, y = make_classification()

# DTC pipeline
featuriser = MinMaxScaler()
dtc = DecisionTreeClassifier()
dtc_pipe = Pipeline([('featuriser', featuriser), ('dtc', dtc)])

# SVC pipeline
scaler = Normalizer()
svc = SVC(C=100, gamma=0.001, kernel='rbf')
svc_pipe = Pipeline(
    [('scaler', scaler), ('svc', svc)])

# Keras pipeline
def get_model():
    # create model
    model = Sequential()
    model.add(Dense(10, input_dim=20, activation='relu'))
    model.add(Dense(1, activation='sigmoid'))
    # Compile model
    model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer='adam', metrics=['accuracy'])
    return model


cnn = KerasClassifier(build_fn=get_model)
cnn._estimator_type = "classifier"
cnn_pipe = Pipeline([('scaler', scaler), ('cnn', cnn)])


# Make an ensemble
ensemble = VotingClassifier(estimators=[('dtc', dtc_pipe), 
                                        ('svc', svc_pipe),
                                        ('cnn', cnn_pipe)], 
                            voting='hard')

ensemble.fit(X, y)

以管道作为估计器的投票分类器

VotingClassifier with pipelines as estimators

python

pipeline

scikit-learn

ensemble-learning

keras