用 scipy solve_bvp 求解边界值问题(扩散反应方程)
Solving a boundary value problem (diffusion-reaction equation) with scipy solve_bvp
我正在努力解决以下二阶边界值问题:
y'' + 2/x*y' + k**2.0*F(y) = 0
y(x=1)=1, y'(x=0)=0
F(y) = -y or F(y) = -y*exp(AB*(1-y)/(1+B(1-y))
不知何故我没能正确设置边界条件。我通过以下方式定义了 F(y)=y
和边界条件的函数:
def fun(x, y, p):
k = p[0]
return np.vstack((y[1], -2.0/x*y[1] + k**2.0*y[0]))
def bc(ya, yb, p):
return np.array([ya[0], yb[0],ya[1]])
y[0,:] = 1
y[1,0] = 0
sol = solve_bvp(fun, bc, x, y, p=[40])
我应该得到的结果肯定是错误的,改变初始条件并不能使事情变得更好。我认为我的问题与 x=0 处的零梯度边界条件有何关系。有人知道我做错了什么吗?
编辑:
这里是一个 MWE,对于 k=0.01,它应该给出一个常数值 1。但是对于 k=5,x=0 处的值应该是大约。 0.06:
def fun(x, y, p):
k = p[0]
return np.vstack((y[1], -2.0/x*y[1] + k**2.0*y[0]))
def bc(ya, yb, p):
return np.array([ya[0], yb[0]-1.0,yb[1]])
x = np.linspace(1e-3, 1, 100)
y = np.zeros((2, x.size))
y[0,:] = 1
from scipy.integrate import solve_bvp
sol = solve_bvp(fun, bc, x, y, p=[1000])
x_plot = np.linspace(0, 1, 100)
y_plot = sol.sol(x_plot)[0]
plt.figure()
plt.plot(x_plot, y_plot)
考虑案例 F(y)=y
。那么很容易看出这个线性ODE的基解是sin(k*x)/x
和cos(kx/x)
。类似地,F(y)=-y
得到 sinh(k*x)/x
和 cosh(k*x)/x
。这意味着大多数解决方案在 x=0
处具有奇点。对于标准 ODE 求解器来说,开箱即用地处理这种奇点几乎是不可能的。必须在奇点处帮助求解器,在距奇点一定距离处再次应用正常程序。
你能做的就是分析一下x=0
的情况,稍微挪开一点。
你通过差商的极限得到
y''(0) + 2*y''(0) + k^2*F(y(0)) = 0
它允许您计算二次泰勒多项式。因此,使用 [0,a]
.
上奇点 y(x)=y(0)-k**2/6*F(y(0))*x**2
的延拓,使用 ODE 求解器解决 [a, 1]
上的问题
x=a
处的边界条件以 y0=y(0)
为参数最容易建立。 ODE 和 BC 函数则为
def ode(x,y,y0): return [ y[1], -2*y[1]/x - k**2*F(y[0]) ]
def bc(ya,yb,y0): y2 = -k**2*F(y0)/6; return [ ya[0] - y0 - y2*a**2, ya[1] - 2*y2*a, yb[0]-1 ]
在问题中讨论的情况下,这给出了
a = 1e-2
def F(y): return -y
for k in [0.01, 5]:
res = solve_bvp(ode, bc, [a,1], [[1,1], [0,0]], p=[1], tol=1e-5)
print(f'k={k}: {res.message}, y0={res.p[0]}, theory: {k/np.sinh(k)}')
if res.success:
y0 = res.p[0]
x = np.linspace(a,1,61);
plt.plot(x, res.sol(x)[0])
plt.plot([0], [y0],'o', res.x, res.y[0],'+', ms=4)
plt.title(f'k={k}'); plt.grid(); plt.show()
结果
k=0.01: The algorithm converged to the desired accuracy., y0=0.9999833335277726, theory: 0.9999833335277757
k=5: The algorithm converged to the desired accuracy., y0=0.06738256929427147, theory: 0.06738252915294544
我正在努力解决以下二阶边界值问题:
y'' + 2/x*y' + k**2.0*F(y) = 0
y(x=1)=1, y'(x=0)=0
F(y) = -y or F(y) = -y*exp(AB*(1-y)/(1+B(1-y))
不知何故我没能正确设置边界条件。我通过以下方式定义了 F(y)=y
和边界条件的函数:
def fun(x, y, p):
k = p[0]
return np.vstack((y[1], -2.0/x*y[1] + k**2.0*y[0]))
def bc(ya, yb, p):
return np.array([ya[0], yb[0],ya[1]])
y[0,:] = 1
y[1,0] = 0
sol = solve_bvp(fun, bc, x, y, p=[40])
我应该得到的结果肯定是错误的,改变初始条件并不能使事情变得更好。我认为我的问题与 x=0 处的零梯度边界条件有何关系。有人知道我做错了什么吗?
编辑: 这里是一个 MWE,对于 k=0.01,它应该给出一个常数值 1。但是对于 k=5,x=0 处的值应该是大约。 0.06:
def fun(x, y, p):
k = p[0]
return np.vstack((y[1], -2.0/x*y[1] + k**2.0*y[0]))
def bc(ya, yb, p):
return np.array([ya[0], yb[0]-1.0,yb[1]])
x = np.linspace(1e-3, 1, 100)
y = np.zeros((2, x.size))
y[0,:] = 1
from scipy.integrate import solve_bvp
sol = solve_bvp(fun, bc, x, y, p=[1000])
x_plot = np.linspace(0, 1, 100)
y_plot = sol.sol(x_plot)[0]
plt.figure()
plt.plot(x_plot, y_plot)
考虑案例 F(y)=y
。那么很容易看出这个线性ODE的基解是sin(k*x)/x
和cos(kx/x)
。类似地,F(y)=-y
得到 sinh(k*x)/x
和 cosh(k*x)/x
。这意味着大多数解决方案在 x=0
处具有奇点。对于标准 ODE 求解器来说,开箱即用地处理这种奇点几乎是不可能的。必须在奇点处帮助求解器,在距奇点一定距离处再次应用正常程序。
你能做的就是分析一下x=0
的情况,稍微挪开一点。
你通过差商的极限得到
y''(0) + 2*y''(0) + k^2*F(y(0)) = 0
它允许您计算二次泰勒多项式。因此,使用 [0,a]
.
y(x)=y(0)-k**2/6*F(y(0))*x**2
的延拓,使用 ODE 求解器解决 [a, 1]
上的问题
x=a
处的边界条件以 y0=y(0)
为参数最容易建立。 ODE 和 BC 函数则为
def ode(x,y,y0): return [ y[1], -2*y[1]/x - k**2*F(y[0]) ]
def bc(ya,yb,y0): y2 = -k**2*F(y0)/6; return [ ya[0] - y0 - y2*a**2, ya[1] - 2*y2*a, yb[0]-1 ]
在问题中讨论的情况下,这给出了
a = 1e-2
def F(y): return -y
for k in [0.01, 5]:
res = solve_bvp(ode, bc, [a,1], [[1,1], [0,0]], p=[1], tol=1e-5)
print(f'k={k}: {res.message}, y0={res.p[0]}, theory: {k/np.sinh(k)}')
if res.success:
y0 = res.p[0]
x = np.linspace(a,1,61);
plt.plot(x, res.sol(x)[0])
plt.plot([0], [y0],'o', res.x, res.y[0],'+', ms=4)
plt.title(f'k={k}'); plt.grid(); plt.show()
结果
k=0.01: The algorithm converged to the desired accuracy., y0=0.9999833335277726, theory: 0.9999833335277757
k=5: The algorithm converged to the desired accuracy., y0=0.06738256929427147, theory: 0.06738252915294544