如何检测图像中的光点?
How to detect light spots in image?
为了检测某个地理区域的 inselbergs,我下载了该区域的地形图像(地势和斜度)。斜率图像似乎最适合这项任务。
应用高斯模糊(或使用 ImageMagick 的更快的普通模糊)后,图像似乎已准备好进行自动检测。
现在我想知道 best/fastest 检测黑色背景上这些白色污渍的方法。我的第一个想法是使用一个简单的函数(没有外部库),它的工作原理类似于绘图程序的 "bucket paint" 函数,计算比预定义阈值亮的对象的面积。问题是:由于图像非常大,5400x3600 像素,通常的递归函数可能会导致堆栈溢出,特别是在像下面这样的大山脉上。
那么,有什么建议吗?我认为理想的语言可能是 C++(也许 JavaScript)。我不习惯Python。也许使用像 OpenCV 这样的库会更容易,但也许问题太微不足道,无法请求外部库(包括隐含的学习曲线)。
TIFF图像来自here(我可以将它们转换成其他格式进行处理)。示例图像位于 17S42 四面体("Declividade" 选项),靠近坐标 18°S 41°W。在中间的图像(上图)中,每个 "white ball" 都是一个 inselberg。精度将取决于所选择的灰度阈值。
一种方法是使用 ImageMagick 连接组件并在适当的阈值后从每个白色区域提取质心。
这是 ImageMagick 6 中的命令行。但如果需要,您可以使用 C+ API。
毛边图像:
convert blur.png -auto-level -threshold 65% -type bilevel \
-define connected-components:verbose=true \
-define connected-components:mean-color=true \
-connected-components 4 binary.png |\
grep "gray(255)" | awk '{print }'
质心(像素坐标):
915.9,367.4
873.4,76.8
936.4,269.5
664.8,212.0
598.2,554.3
954.0,59.3
732.6,446.0
353.5,696.4
69.7,848.0
750.4,357.6
537.5,609.9
832.0,230.9
517.9,539.1
阈值图像:
简而言之,使用您的方法您将得到一个非常差的尺寸估计值。模糊区域的边缘,无论您选择什么阈值,都不对应于您要测量的 inselbergs 的边缘。
相反,我建议您遵循以下食谱。为此,我在 Python 中使用 DIPlib(免责声明:我是作者)。 Python 绑定是 C++ 库上的薄层,将下面的 Python 代码转换为 C++ 相当简单(我更容易在 Python 中交互式开发它)。使用 pip install diplib
.
安装
我从您提供的 link 下载了原始高度数据(而不是倾斜度)。 DIPlib 可以直接读取浮点值的 TIFF 文件,因此不需要任何特殊的转换。我裁剪了一个类似于 OP 用于此演示的区域,但没有理由不将该方法应用于整个图块。
import diplib as dip
height = dip.ImageRead('17S42_ZN.tif')
height.SetPixelSize(0.000278, 'rad') # not really radian, but we don't have degrees
height = height[3049:3684, 2895:3513];
代码还根据 TIFF 文件中的数据设置像素大小(使用弧度单位,因为 DIPlib 不计算度数)。
接下来,我应用特定直径(25 像素)的顶帽滤镜。这将隔离所有直径为 25 像素或更小的峰。根据您认为 inselberg 的最大宽度调整此大小。
local_height = dip.Tophat(height, 25)
实际上,结果是局部高度,即高于某个基线的高度,由过滤器的大小决定。
接下来,我应用滞后阈值(双阈值)。这会产生一个二进制图像,在基线以上 100 米处设置阈值,其中地形在基线以上 200 米以上。也就是说,我决定在基线以上至少 200 米处设置一个岛山,但在 100 米处将每个岛山切断。在这个高度,我们将测量尺寸(面积)。同样,根据需要调整阈值。
inselbergs = dip.HysteresisThreshold(local_height, 100, 200)
现在剩下的就是测量我们找到的区域:
labels = dip.Label(inselbergs)
result = dip.MeasurementTool.Measure(labels, features=['Size', 'Center'])
print(result)
这输出:
| Size | Center |
-- | ---------- | ----------------------- |
| | dim0 | dim1 |
| (rad²) | (rad) | (rad) |
-- | ---------- | ---------- | ---------- |
1 | 1.863e-05 | 0.1514 | 0.01798 |
2 | 4.220e-05 | 0.1376 | 0.02080 |
3 | 6.214e-05 | 0.09849 | 0.04429 |
4 | 6.492e-06 | 0.1282 | 0.04710 |
5 | 3.022e-05 | 0.1354 | 0.04925 |
6 | 4.274e-05 | 0.1510 | 0.05420 |
7 | 2.218e-05 | 0.1228 | 0.05802 |
8 | 1.932e-05 | 0.1420 | 0.05689 |
9 | 7.690e-05 | 0.1493 | 0.06960 |
10 | 3.285e-05 | 0.1120 | 0.07089 |
11 | 5.248e-05 | 0.1389 | 0.07851 |
12 | 4.637e-05 | 0.1096 | 0.09016 |
13 | 3.787e-05 | 0.07146 | 0.1012 |
14 | 2.133e-05 | 0.09046 | 0.09908 |
15 | 3.895e-05 | 0.08553 | 0.1064 |
16 | 3.308e-05 | 0.09972 | 0.1143 |
17 | 3.277e-05 | 0.05312 | 0.1174 |
18 | 2.581e-05 | 0.07298 | 0.1167 |
19 | 1.955e-05 | 0.04038 | 0.1304 |
20 | 4.846e-05 | 0.03657 | 0.1448 |
(请记住,它说 'rad' 的地方实际上是度数。)平方度数的面积有点奇怪,但您可以将其转换为平方米,因为您知道地球上的位置。实际上,在计算之前将像素大小转换为米可能更容易。
此处为 'Center' 给出的值是相对于左上角像素的,如果我们一开始没有裁剪图块,我们可以添加图块的坐标(可以从TIFF文件中对应的标签获取:(-42.0, -17.0).
在 C++ 中,代码应如下所示:
#include <diplib/simple_file_io.h>
#include <diplib/morphology.h>
#include <diplib/segmentation.h>
#include <diplib/regions.h>
#include <diplib/measurement.h>
//...
dip::Image height = dip::ImageRead("17S42_ZN.tif");
height.SetPixelSize(0.000278 * dip::Units::Radian());
height = height.At(dip::Range(3049, 3684), dip::Range(2895, 3513));
dip::Image local_height = dip::Tophat(height, 25);
dip::Image inselbergs = dip::HysteresisThreshold(local_height, 100, 200);
dip::Image labels = dip::Label(inselbergs);
dip::MeasurementTool measurementTool;
dip::Measurement result = measurementTool.Measure(labels, {}, {"Size", "Center"});
std::cout << result;
为了检测某个地理区域的 inselbergs,我下载了该区域的地形图像(地势和斜度)。斜率图像似乎最适合这项任务。
应用高斯模糊(或使用 ImageMagick 的更快的普通模糊)后,图像似乎已准备好进行自动检测。
现在我想知道 best/fastest 检测黑色背景上这些白色污渍的方法。我的第一个想法是使用一个简单的函数(没有外部库),它的工作原理类似于绘图程序的 "bucket paint" 函数,计算比预定义阈值亮的对象的面积。问题是:由于图像非常大,5400x3600 像素,通常的递归函数可能会导致堆栈溢出,特别是在像下面这样的大山脉上。
那么,有什么建议吗?我认为理想的语言可能是 C++(也许 JavaScript)。我不习惯Python。也许使用像 OpenCV 这样的库会更容易,但也许问题太微不足道,无法请求外部库(包括隐含的学习曲线)。
TIFF图像来自here(我可以将它们转换成其他格式进行处理)。示例图像位于 17S42 四面体("Declividade" 选项),靠近坐标 18°S 41°W。在中间的图像(上图)中,每个 "white ball" 都是一个 inselberg。精度将取决于所选择的灰度阈值。
一种方法是使用 ImageMagick 连接组件并在适当的阈值后从每个白色区域提取质心。
这是 ImageMagick 6 中的命令行。但如果需要,您可以使用 C+ API。
毛边图像:
convert blur.png -auto-level -threshold 65% -type bilevel \
-define connected-components:verbose=true \
-define connected-components:mean-color=true \
-connected-components 4 binary.png |\
grep "gray(255)" | awk '{print }'
质心(像素坐标):
915.9,367.4
873.4,76.8
936.4,269.5
664.8,212.0
598.2,554.3
954.0,59.3
732.6,446.0
353.5,696.4
69.7,848.0
750.4,357.6
537.5,609.9
832.0,230.9
517.9,539.1
阈值图像:
简而言之,使用您的方法您将得到一个非常差的尺寸估计值。模糊区域的边缘,无论您选择什么阈值,都不对应于您要测量的 inselbergs 的边缘。
相反,我建议您遵循以下食谱。为此,我在 Python 中使用 DIPlib(免责声明:我是作者)。 Python 绑定是 C++ 库上的薄层,将下面的 Python 代码转换为 C++ 相当简单(我更容易在 Python 中交互式开发它)。使用 pip install diplib
.
我从您提供的 link 下载了原始高度数据(而不是倾斜度)。 DIPlib 可以直接读取浮点值的 TIFF 文件,因此不需要任何特殊的转换。我裁剪了一个类似于 OP 用于此演示的区域,但没有理由不将该方法应用于整个图块。
import diplib as dip
height = dip.ImageRead('17S42_ZN.tif')
height.SetPixelSize(0.000278, 'rad') # not really radian, but we don't have degrees
height = height[3049:3684, 2895:3513];
代码还根据 TIFF 文件中的数据设置像素大小(使用弧度单位,因为 DIPlib 不计算度数)。
接下来,我应用特定直径(25 像素)的顶帽滤镜。这将隔离所有直径为 25 像素或更小的峰。根据您认为 inselberg 的最大宽度调整此大小。
local_height = dip.Tophat(height, 25)
实际上,结果是局部高度,即高于某个基线的高度,由过滤器的大小决定。
接下来,我应用滞后阈值(双阈值)。这会产生一个二进制图像,在基线以上 100 米处设置阈值,其中地形在基线以上 200 米以上。也就是说,我决定在基线以上至少 200 米处设置一个岛山,但在 100 米处将每个岛山切断。在这个高度,我们将测量尺寸(面积)。同样,根据需要调整阈值。
inselbergs = dip.HysteresisThreshold(local_height, 100, 200)
现在剩下的就是测量我们找到的区域:
labels = dip.Label(inselbergs)
result = dip.MeasurementTool.Measure(labels, features=['Size', 'Center'])
print(result)
这输出:
| Size | Center |
-- | ---------- | ----------------------- |
| | dim0 | dim1 |
| (rad²) | (rad) | (rad) |
-- | ---------- | ---------- | ---------- |
1 | 1.863e-05 | 0.1514 | 0.01798 |
2 | 4.220e-05 | 0.1376 | 0.02080 |
3 | 6.214e-05 | 0.09849 | 0.04429 |
4 | 6.492e-06 | 0.1282 | 0.04710 |
5 | 3.022e-05 | 0.1354 | 0.04925 |
6 | 4.274e-05 | 0.1510 | 0.05420 |
7 | 2.218e-05 | 0.1228 | 0.05802 |
8 | 1.932e-05 | 0.1420 | 0.05689 |
9 | 7.690e-05 | 0.1493 | 0.06960 |
10 | 3.285e-05 | 0.1120 | 0.07089 |
11 | 5.248e-05 | 0.1389 | 0.07851 |
12 | 4.637e-05 | 0.1096 | 0.09016 |
13 | 3.787e-05 | 0.07146 | 0.1012 |
14 | 2.133e-05 | 0.09046 | 0.09908 |
15 | 3.895e-05 | 0.08553 | 0.1064 |
16 | 3.308e-05 | 0.09972 | 0.1143 |
17 | 3.277e-05 | 0.05312 | 0.1174 |
18 | 2.581e-05 | 0.07298 | 0.1167 |
19 | 1.955e-05 | 0.04038 | 0.1304 |
20 | 4.846e-05 | 0.03657 | 0.1448 |
(请记住,它说 'rad' 的地方实际上是度数。)平方度数的面积有点奇怪,但您可以将其转换为平方米,因为您知道地球上的位置。实际上,在计算之前将像素大小转换为米可能更容易。
此处为 'Center' 给出的值是相对于左上角像素的,如果我们一开始没有裁剪图块,我们可以添加图块的坐标(可以从TIFF文件中对应的标签获取:(-42.0, -17.0).
在 C++ 中,代码应如下所示:
#include <diplib/simple_file_io.h>
#include <diplib/morphology.h>
#include <diplib/segmentation.h>
#include <diplib/regions.h>
#include <diplib/measurement.h>
//...
dip::Image height = dip::ImageRead("17S42_ZN.tif");
height.SetPixelSize(0.000278 * dip::Units::Radian());
height = height.At(dip::Range(3049, 3684), dip::Range(2895, 3513));
dip::Image local_height = dip::Tophat(height, 25);
dip::Image inselbergs = dip::HysteresisThreshold(local_height, 100, 200);
dip::Image labels = dip::Label(inselbergs);
dip::MeasurementTool measurementTool;
dip::Measurement result = measurementTool.Measure(labels, {}, {"Size", "Center"});
std::cout << result;