如何将 DICOM 文件中的存储值转换为真实世界的单位？

Question

我正在尝试使用 Matlab 或 python 计算 PET DICOM 图像上的放射性浓度。我在 DICOM 标准中读到

(0028,1053) Rescale Slope    
(0028,1052) Rescale Intercept

可用于将存储的 16 位单位（在我的例子中）映射到实际单位。这些文件还包含以下元素：

(0040,9096) Real World Value Mapping Sequence    
(0028,9145) Pixel Value Transformation Sequence

作为 (5200,9230) Per Frame Functional Groups Sequence（对于动态测量中的每个帧）或 (5200,9229) Shared Functional Groups Sequence（对于静态测量）的一部分。这些序列还包含重新调整斜率和截距。这些值彼此匹配（对于给定帧，(0040,9096) Real World Value Mapping Sequence 和 (0028,9145) Pixel Value Transformation Sequence 值相同）但它们与 "main" 斜率和截距的值不匹配（即PET 图像模块的属性）。例如，在使用 pydicom 作为 ds 读取动态 multi-frame 文件后：

#This is the "main" slope, part of the PET Image module    
>ds.RescaleSlope  
Out[31]: "0.478081"

#This is a dynamic image, for a static image SharedFunctionalGroupsSequence would be used
>ds.PerFrameFunctionalGroupsSequence[0].PixelValueTransformationSequence[0].RescaleSlope
Out[34]: "104.435089"

>ds.PerFrameFunctionalGroupsSequence[0].RealWorldValueMappingSequence[0].RealWorldValueSlope
Out[38]: 104.43508911132812

我的问题如下：我如何正确应用这些转换以从像素值中获取真实世界的单位（例如：Bq/ml，如 header 中所述）？我是否需要同时乘以 ds.RescaleSlope 和 RealWorldValueSlope？（在我的例子中截距总是 0）。这似乎违反直觉，因为 dicom 标准 states 这两个值实际上彼此没有任何关系，但是 ds.RescaleSlope 有什么作用？

感谢任何帮助。

Answer 1

如果遵循 David Clunie in this post，在这种情况下应使用 Real World Value Mapping Sequence，如果不支持，Rescale/Slope 将作为后备。我自己还没有使用 Real World Value Mapping Sequence（如果存在，总是在显示管道中应用模态 LUT），所以我对此并不完全确定...

如何将 DICOM 文件中的存储值转换为真实世界的单位？

How to transform stored values in a DICOM file to real world units?

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