使用 R 栅格进行交互式绘图：鼠标悬停时的值

Question

我想在 R 中编写一个小程序，用于交互式可视化和修改一些栅格数据集，这些数据集被视为彩色图像。用户应该打开一个文件（从终端就可以），绘制它，select 用鼠标点击要编辑的点，然后插入新值。

到目前为止，我很容易就做到了。我使用 raster 包中的 plot() 函数来可视化绘图，然后使用 click() 到 select 点并通过终端编辑它们的值。

我想添加在鼠标悬停时显示值的功能。我已经搜索了如何执行此操作的方法，但这似乎无法通过标准 R 包实现。这是正确的吗？

在这种情况下，我可能被迫使用外部包，例如 gGobi、iPlots、Shiny 或 Plotly。但是，我更喜欢 KISS 并且只使用 "standard" 图形工具，例如光栅 plot() 函数或网格图形对象（例如来自 rasterVis）。

我知道 Shiny 应用程序可能是最好的，但它需要很多时间来学习和完善。

Answer 1

我给你一个简单的例子，说明如何在没有外部 Java 库的情况下在 R 中做到这一点，如果你想要 Javan 的功能，你可以调整它，但是每个 java 图形图书馆是不同的，我从来没有做过类似的事情。

set.seed(123)
mydata <- data.frame(x = runif(10), y = runif(10))

edit_plot <- function(data) {
  plot(data)

  sel <- locator(n = 1)
  if(is.null(sel)) return(TRUE)
  dd <- (data$x - sel$x)^2 + (data$y - sel$y)^2

  data[which.min(dd),] <- edit(data[which.min(dd),])
  r <- edit_plot(data)
  if(r) return(TRUE)
}
edit_plot(mydata)

要在定位器处于活动状态时按 Esc 键退出。

Answer 2

使用 leaflet、mapview 和 leafem 你可以达到这样的效果：

library(raster)
library(mapview)
library(leaflet)
library(leafem)

f <- system.file("external/test.grd", package="raster")
r <- raster(f)

leaflet() %>% 
  addRasterImage(r, layerId = "values") %>% 
  addMouseCoordinates() %>%
  addImageQuery(r, type="mousemove", layerId = "values")

将其放入 shiny 应用程序中，您将获得：

library(raster)
library(mapview)
library(leaflet)
library(shiny)

f <- system.file("external/test.grd", package="raster")
r <- raster(f)

ui <- fluidPage(
  leafletOutput("map")
)

server <- function(input, output){
  output$map <- renderLeaflet({
    leaflet() %>% 
      addRasterImage(r, layerId = "values") %>% 
      addMouseCoordinates() %>%
      addImageQuery(r, type="mousemove", layerId = "values")
  })
}

shinyApp(ui, server)

以下示例说明了将栅格转换为简单要素/形状文件的想法。它对大文件不太有用，但标签可以单独设计，数据是 可编辑的 并且可以很容易地显示在 Table.

中

library(raster)
library(leaflet)
library(shiny)
library(sf)
library(DT)
library(dplyr)

## DATA
f <- system.file("external/test.grd", package="raster")
r <- raster(f)
r1 = aggregate(r, 30)

sp = st_as_sf(rasterToPolygons(r1))
cn = st_coordinates(st_transform(st_centroid(sp),4326))
sp = st_transform(sp, 4326)
sp = cbind(sp, cn)
sp$id <- 1:nrow(sp)
colnames(sp)[1] <- "value"


## UI
ui <- fluidPage(
  leafletOutput("map"),
  uiOutput("newValueUI"),
  textInput("newVal", label = "Enter new value"),
  actionButton("enter", "Enter new value"),
  hr(),
  dataTableOutput("table")
)


## SERVER
server <- function(input, output){

  ## Reactive Shapefile
  sp_react <- reactiveValues(sp = sp)
  
  ## Leaflet Map
  output$map <- renderLeaflet({
    pal= colorNumeric(topo.colors(25), sp_react$sp$value)
    leaflet() %>% 
      addPolygons(data = sp_react$sp, label= paste(
        "Lng: ", as.character(round(sp_react$sp$X,4)),
        "Lat: ", as.character(round(sp_react$sp$Y,4)),
        "Val: ", as.character(round(sp_react$sp$value,4))),
        color = ~pal(sp_react$sp$value), 
        layerId = sp_react$sp$id
      )
  })
  
  ## Observe Map Clicks
  observeEvent(input$map_shape_click, {
    
    click_id = input$map_shape_click$id
    
    click_grid <- sp_react$sp[sp_react$sp$id == click_id,]

  })
  
  ## Observe Action Button
  observeEvent(input$enter, {
    click_id <- input$map_shape_click$id
    sp_react$sp[sp_react$sp$id == click_id,]$value <- as.numeric(input$newVal)
  })

  ## Data Table
  output$table <- DT::renderDataTable({
    sp_react$sp %>% st_set_geometry(NULL) %>% 
      dplyr::select(id,X,Y,value)
  })
  proxy = dataTableProxy('table')
  
  ## Table Proxy
  observeEvent(input$map_shape_click$id, {
    req(input$map_shape_click$id)
    proxy %>% selectRows(as.numeric(input$map_shape_click$id))
  })
}

shinyApp(ui, server)

使用 R 栅格进行交互式绘图：鼠标悬停时的值

Interactive plotting with R raster: values on mouseover

plot

interactive

r

mouseover

r-raster