如何生成和编制 .Rmd 报告的个性化版本?

How can I generate and knit personalized versions of an .Rmd report?

我创建了一份报告 PerfReport.Rmd,将一个人的表现与一大群人的表现进行比较。我有数百人应该收到这份报告的个性化版本,将他们自己的表现与大组进行比较。

我看到的障碍是: 1. 我需要每个文件名都包含人名。 2. 每个文件都有因人而异的计算。

这里有一个例子.Rmd

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title: "Course Success"

output:
html_document: flexdashboard::flex_dashboard
pdf_document: default

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---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE)
library(dplyr)
library(plotly)
```

```{r comp, echo=FALSE, message=FALSE,warning=FALSE}

df<-data.frame(Person=c('a','a','a','a','a','b','b','b','b','b','c','c','c','c','c','d','d','d','d','d'),
           Success=c(1,0,1,1,0,1,0,0,0,0,1,1,1,1,1,0,1,0,0,1),
           Valid=c(1,1,1,1,1,1,0,1,1,1,1,1,1,0,1,1,1,1,1,1))

testperson<-'b'

comparison<-df%>%
  transmute(Your_Rate=sum(Success[Person==testperson])/sum(Valid[Person==testperson]),
        Baseline=sum(Success[Person!=testperson])/sum(Valid[Person!=testperson]))%>%
  distinct(Your_Rate,.keep_all = TRUE)

plot_ly(comparison,y=~Your_Rate, type='bar')%>%
  add_trace(y=~Baseline)

```

按照我的结构,.Rmd 中的一个变量定义了进行计算的人,我处理文件名的唯一方法是手动保存一个文件,其中包含之前的人名针织。

我猜想如何做到这一点:

  1. 生成 .Rmd 文件并附加每个人的姓名(即 PerfReport_a.Rmd、PerfReport_b.Rmd)并更改每个文件中的 testperson 变量。
  2. 运行 将这些 .Rmd 文件编织成一组 html 文件的脚本。

如果我对这里的一般步骤是正确的,我将第 2 步覆盖在一个 .R 文件中,该文件编织目录中的每个 .Rmd 文件。

files<-list.files("E:/Dashboards/",pattern = "[.]Rmd$")

files2<-as.data.frame(files)
files3<-files2%>%
  mutate(filenow=paste0("E:/Dashboards/",files))

files4<-files3$filenow

for (f in files4) rmarkdown::render(f)

任何帮助生成具有 testperson 的调整值的 .Rmd 文件的方法将不胜感激。如果有更好的方法从一个单一的主 .Rmd 到数百个我想要制作的个性化 .html 仪表板,我也很想学习这种方法!

提前致谢。

您可以使用 yaml 参数 params 来解决这个问题。你需要

  • 一个模板(template.Rmd)
  • 脚本 运行 模板 (script.R)

这是一个简单的小例子:

template.Rmd

---
title: no title
author: Roman
date: "`r Sys.Date()`"
params:
  testperson: NA
---

```{r}
print(params$testperson)
```

```{r}
sessionInfo()
```

script.R

library(rmarkdown)

persons <- c("person1", "person2", "person3")

for (person in persons) {
  rmarkdown::render(input = "template.Rmd",
                    output_file = sprintf("%s_report.html", person),
                    params = list(testperson = person)
                    )
}

这应该会用 personX_report.html 文件填充您的工作文件夹(见下面的屏幕截图)。