构建 r 包时附加 python 脚本

Question

我还没有为我的任务找到一些 R 包（没有，相信我），但是 python 中有一个。所以我写了 python 脚本并在某些函数中使用了 reticulaye::py_run_file('my_script.py') 。但是在构建和安装之后，包找不到那个脚本。我应该把这个脚本放在哪里以便在直接从 package.json 安装后使用它？还有一件事，我需要安装 miniconda reticulate::install_miniconda()。有谁知道在 install.package 命令后自动安装它的方法吗？

Answer 1

通常非 R 代码进入 ./inst/python/your_script.py（同样适用于 JS 等）。 inst 文件夹中的任何内容都将原封不动地安装到包的根目录中。

要在您的包函数中调用这些文件，请使用类似：

reticulate::py_run_file(system.file("python", "your_script.py", package = "yourpkg"))

参见：http://r-pkgs.had.co.nz/inst.html

对于你的第二个问题，你应该在安装任何东西之前提示用户，但你通常会在一个名为 .onLoad 的特殊函数中调用任何外部安装程序，参数为 libname 和 pkgname .这是调用library(yourpkg).

时自动执行的函数

.onLoad <- function(libname, pkgname) {
  user_permission <- utils::askYesNo("Install miniconda? downloads 50MB and takes time")

  if (isTRUE(user_permission)) {
    reticulate::install_miniconda()
    } else {
    message("You should run `reticulate::install_miniconda()` before using this package")
   }
}

您可以将此函数放在任何包 R 文件中。

构建 r 包时附加 python 脚本

Attaching python script while building r package

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