使用网状包从 R 调用 Python

Question

我想在 R 中执行一个 Python 脚本。我已经安装了 reticulate 并测试了 Python 版本已经在我的 R 会话中正确初始化。

py_config()

returns以下

python:         C:/Users/username/AppData/Local/r-miniconda/envs/r-reticulate/python.exe
libpython:      C:/Users/username/AppData/Local/r-miniconda/envs/r-reticulate/python36.dll
pythonhome:     C:/Users/username/AppData/Local/r-miniconda/envs/r-reticulate
version:        3.6.10 |Anaconda, Inc.| (default, Jan  7 2020, 15:18:16) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)]
Architecture:   64bit
numpy:          C:/Users/username/AppData/Local/r-miniconda/envs/r-reticulate/Lib/site-packages/numpy
numpy_version:  1.18.1

现在，当我调用 Python 脚本时

py_run_file("PythonScript.py")

我在 R 中遇到以下错误

Error in py_run_file_impl(file, local, convert) : 
  ModuleNotFoundError: No module named 'requests'

我知道我需要安装请求包，但如何在我初始化的特定 Python 版本中安装它？

Answer 1

您需要先安装python模块requests。

如果你安装了python，你应该已经安装了pip。您可以在命令行中通过运行 pip install requests 安装模块。

Answer 2

您可以编写一个函数来收集丢失的包并安装它们：

run_python_file <- function(python_file){
    a = try(reticulate::py_run_file(python_file),silent=TRUE)
    if(inherits(a,"try-error")& grepl("ModuleNotFoundError",a)){
        system(sprintf("python -m pip install %s",gsub(".* |\W","",c(a))))
        run_python_file(python_file)
      }
    else a
   }
run_python_file("PythonScript.py")

使用网状包从 R 调用 Python

Calling Python from R with reticulate package

python

r

reticulate